典型文献
用于苹果树病毒鉴定的small RNA深度测序数据集
文献摘要：
病毒病是为害苹果的重要致病因子,开展病毒种类鉴定是防控苹果病毒病的首要任务.由于苹果长期通过嫁接的方式进行繁育,导致树体感染多种病毒,加之苹果病毒的浓度较低,序列变异较大,致使苹果病毒种类的鉴定尤为困难.此外,现有的分子检测技术主要为聚合酶链式反应和分子杂交技术,这些技术基于已知病毒核苷酸序列为基础开展鉴定,而对于未知病毒,由于其核苷酸序列尚未测定,则无法采用这些分子技术进行鉴定.针对这一瓶颈,该文提供了一个自然生长的苹果树的small RNA(sRNA)深度测序的数据集,通过结合生物信息学方法对原始数据进行过滤、sRNA组装及Blast比对,可准确地分析和判断自然条件下病毒的种类,为苹果病毒的鉴定带来了新的突破,同时也为苹果无毒苗木的判定提供技术支撑.
文献关键词：
苹果;病毒;鉴定;small RNA测序;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
胡国君;董雅凤;张尊平;范旭东;任芳
作者机构：
中国农业科学院果树研究所,国家落叶果树脱毒中心,兴城125100
文献出处：
引用格式：
[1]胡国君;董雅凤;张尊平;范旭东;任芳-.用于苹果树病毒鉴定的small RNA深度测序数据集)[J].农业大数据学报,2022(02):25-29
A类：
B类：
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AB值：
0.36927
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