典型文献
红海榄肉桂酸-4-羟基化酶基因的克隆与表达分析
文献摘要:
肉桂酸-4-羟基化酶是木质素合成反应中的关键酶,木质素合成反应对于植物耐受重金属胁迫有重要作用.本研究利用同源克隆和cDNA末端快速扩增方法(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从红海榄叶片中克隆得到一条肉桂酸-4-羟基化酶基因,命名为RsC4H,生物信息学分析结果显示RsC4H基因的cDNA全长为2006bp,开放阅读框长1572bp,共编码523个氨基酸.该基因编码蛋白的相对分子质量为60.18kD,是亲水性的不稳定蛋白,二级结构以a螺旋(47.42%)和无规则卷曲(32.70%)为主,该蛋白在N端和C端分别包含一个跨膜结构,不含有信号肽,主要在膜结构或内质网上发挥功能,属于p450超家族.RsC4H蛋白与其他植物的C4H蛋白相似性较高,系统发育树结果显示其与笋瓜(Cucurbita maxima,XP_023007159.1)、南瓜(Cucurbita moschata,XP_022947682.1)的亲缘关系更近.qRT-PCR 结果显示,红海榄能快速响应重金属胁迫,提高RsC4H基因的表达量,促进木质素生成并增加细胞壁厚度以阻止金属离子进入细胞.此研究结果丰富了红树植物抗重金属胁迫基因库,为从分子水平揭示红海榄耐受重金属胁迫机制提供了基础资料.
文献关键词:
红海榄;肉桂酸-4-羟基化酶;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号:
作者姓名:
谢勇;王友绍;张维仕
作者机构:
热带海洋环境国家重点实验室(中国科学院南海海洋研究所),广东广州510301;中国科学院大亚湾海洋生物综合试验站,广东深圳518121;中国科学院南海生态环境工程创新研究院,广东广州510301;中国科学院大学,北京100049;南方海洋科学与工程广东省实验室(广州),广东广州511458;临沂市白沙埠中学,山东 临沂276035
文献出处:
引用格式:
[1]谢勇;王友绍;张维仕-.红海榄肉桂酸-4-羟基化酶基因的克隆与表达分析)[J].热带海洋学报,2022(06):20-27
A类:
RsC4H,2006bp,1572bp,18kD
B类:
红海榄,肉桂酸,羟基化,酶基因,克隆与表达,表达分析,木质素,合成反应,关键酶,受重,重金属胁迫,研究利用,同源克隆,cDNA,增方,rapid,amplification,ends,RACE,生物信息学分析,全长,开放阅读框,基因编码,编码蛋白,相对分子质量,亲水性,二级结构,无规则,卷曲,膜结构,信号肽,内质网,p450,超家族,白相,系统发育树,笋瓜,Cucurbita,maxima,XP,南瓜,moschata,亲缘关系,qRT,快速响应,加细,细胞壁,壁厚,金属离子,红树植物,抗重金属,基因库,分子水平,胁迫机制,基础资料,基因克隆
AB值:
0.359135
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