典型文献
条斑紫菜DnaJ基因家族鉴定及其在环境胁迫下的表达分析
文献摘要：
针对条斑紫菜(Pyropia yezoensis)DnaJ(PyDnaJ)家族研究相对较少的现状,本研究利用生物信息学方法对PyDnaJ基因家族及其在胁迫条件下的表达模式进行探究,以便为进一步解析条斑紫菜抗逆机制奠定前期工作基础.本研究鉴定出27个DnaJ蛋白(PyDnaJ01～27),并发现:其编码氨基酸数量范围为191～980;大部分DnaJ定位于高尔基体和细胞核;成员的基因结构简单,内含子较少;根据所含结构域不同可分为A、B、C三类;27个成员散布于3条染色体上.其中:PY_1染色体含DnaJ基因最多(11个);PyDnaJ01和PyDnaJ10为片段重复基因;PY_2和PY_3染色体上各有8个DnaJ基因;DnaJ基因启动子区域含有不同数目的胁迫响应元件和植物激素响应元件.系统发生分析表明PyDnaJ蛋白家族可以分成10个亚群.qRT-PCR结果显示,PyDnaJ家族成员在孢子体世代下的表达水平显著高于配子体世代,PyD-naJ家族成员在失水及温度胁迫下具有不同表达模式.
文献关键词：
条斑紫菜;DnaJ;基因家族;失水胁迫;温度胁迫
中图分类号：
作者姓名：
孙斌;孔凡娜;殷吉强
作者机构：
中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东 青岛266003
文献出处：
引用格式：
[1]孙斌;孔凡娜;殷吉强-.条斑紫菜DnaJ基因家族鉴定及其在环境胁迫下的表达分析)[J].中国海洋大学学报（自然科学版）,2022(12):51-61
A类：
PyDnaJ,PyDnaJ01,PyDnaJ10,PyD,naJ
B类：
条斑紫菜,基因家族鉴定,环境胁迫,表达分析,Pyropia,yezoensis,家族研究,研究利用,利用生物,生物信息学方法,胁迫条件,表达模式,抗逆,前期工作,高尔基体,细胞核,基因结构,结构简单,内含子,所含,结构域,散布,PY,基因启动子区,启动子区域,胁迫响应,响应元,植物激素,激素响应,系统发生分析,白家,亚群,qRT,孢子体,世代,配子体,温度胁迫,失水胁迫
AB值：
0.298301
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