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典型文献
部分春大豆主栽品种叶绿素含量全基因组关联分析
文献摘要:
叶绿素是植物光合作用主要色素,对大豆产量形成具有重要影响.利用196份已重测序的国内外品种构成自然群体为试验材料,测定该群体苗期叶绿素含量,结合混合线性模型(Mixed linear model)进行全基因组关联分析.结果表明,根据阈值筛选得到37个显著相关SNP位点,分别位于第2、3、4、7、10、13、16号染色体上,在SNP位点上下游各100 kb搜索到194个相关基因.通过GO功能富集分析、KEGG代谢通路富集分析及基因功能注释,筛选得到11个可能与叶绿素含量相关的候选基因,通过相对表达量分析鉴定得到4个Glyma.02G185300、Glyma.03G085000、Glyma.10G259900、Glyma.16G037100与大豆叶绿素含量相关基因.研究结果为探究大豆叶绿素含量遗传机理提供理论参考.
文献关键词:
大豆;叶绿素含量;全基因组关联分析;候选基因
作者姓名:
张大勇;王象然;吴雨恒;赫晨宇;杨柳;贾璐;庄静而
作者机构:
东北农业大学农学院,哈尔滨 150030;黑龙江省农业科学院佳木斯分院/国家大豆产业技术体系佳木斯综合试验站/三江平原主要作物育种栽培重点实验室,黑龙江 佳木斯 154007
引用格式:
[1]张大勇;王象然;吴雨恒;赫晨宇;杨柳;贾璐;庄静而-.部分春大豆主栽品种叶绿素含量全基因组关联分析)[J].东北农业大学学报,2022(12):1-9
A类:
02G185300,03G085000,10G259900,16G037100
B类:
春大豆,主栽品种,叶绿素含量,全基因组关联分析,光合作用,大豆产量,产量形成,重测序,苗期,混合线性模型,Mixed,linear,model,阈值筛选,选得,SNP,上下游,kb,功能富集分析,代谢通路,通路富集分析,基因功能注释,候选基因,相对表达量,表达量分析,分析鉴定,Glyma,豆叶,遗传机理
AB值:
0.29752
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