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典型文献
马铃薯StDRO1基因的多态性鉴定及其与根系性状的关联分析
文献摘要:
为鉴定与马铃薯根系性状相关联的StDRO1基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,本研究对110份同源四倍体马铃薯材料StDRO1基因的编码区进行了克隆和测序,筛选其SNP,并对StDRO1的SNP位点与马铃薯总根表面积、总根体积和平均根系直径等主要根系性状参数进行了关联分析.结果显示,StDRO1第2外显子上检测到1个SNP位点,命名为G64C;第3外显子上检测到10个SNP位点,分别命名为G152A、A214G、A297G、C314T、A337T、T353C、T560A、C577A、C620A和C625A;在第4外显子上检测到1个SNP位点,命名为T793A.关联分析结果表明,StDRO1基因G152A位点在总根体积表现为GA类基因型>GG类基因型(P<0.05);C314T位点在平均根系直径表现为CC类基因型>CT类基因型(P<0.05);A337T位点在总根表面积、鲜重和干重均表现为AT类基因型>AA类基因型(P<0.05),而在平均根系直径则表现为AA类基因型>AT类基因型(P<0.05);T353C位点在总根表面积、总根体积和鲜重均表现为TC类基因型>TT类基因型(P<0.05);C620A位点在总根体积表现为CA类基因型>CC类基因型(P<0.05);T793A位点在总根表面积、总根体积和鲜重均表现为AT类基因型>TT类基因型(P<0.05).综上,StDRO1基因的上述6个SNP对马铃薯根系性状有显著影响,其中A337T、T353C和T793A位点尤为重要.研究结果为后续马铃薯根系构型研究和遗传改良提供了理论参考,但能否作为马铃薯根系性状遗传标记还需扩大群体样本进一步验证.
文献关键词:
马铃薯;StDRO1基因;根系性状;关联分析;SNP
作者姓名:
许德蓉;孙超;毕真真;秦天元;王一好;李成举;范又方;刘寅笃;张俊莲;白江平
作者机构:
甘肃省干旱生境作物学重点实验室 / 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室, 甘肃兰州 730070;甘肃农业大学农学院, 甘肃兰州 730070
文献出处:
引用格式:
[1]许德蓉;孙超;毕真真;秦天元;王一好;李成举;范又方;刘寅笃;张俊莲;白江平-.马铃薯StDRO1基因的多态性鉴定及其与根系性状的关联分析)[J].作物学报,2022(01):76-85
A类:
StDRO1,G64C,G152A,A214G,A297G,C314T,A337T,T353C,T560A,C577A,C620A,C625A,T793A
B类:
马铃薯,根系性状,相关联,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphism,SNP,同源四倍体,编码区,根体积,根系直径,外显子,GA,基因型,GG,CC,鲜重,干重,AT,AA,TT,CA,根系构型,遗传改良,性状遗传,遗传标记,大群体
AB值:
0.141758
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