典型文献
白耳黄鸡三叉冠性状分析
文献摘要：
[目的]对白耳黄鸡三叉冠性状进行分析,以期寻找与三叉冠性状相关的候选单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点.[方法]60只白耳黄鸡用于杂交试验,120只白耳黄鸡用于受精率试验.对82只白耳黄鸡采集血样抽提DNA,用Illumina鸡60 k芯片进行基因型分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用GEMMA软件对SNP与性状进行全基因组关联分析(Genome-wide Association Analysis,GWAS),寻找与白耳黄鸡三叉冠性状显著相关的SNP位点.[结果]白耳黄鸡三叉冠呈现常染色体遗传,其种蛋受精率与单冠的白耳黄鸡差异不显著.由82只白耳黄鸡群体得到55023个有效SNP,群体内不存在明显的群体分层.与三叉冠相关的SNP位点有10个,分别位于第1、2、3、4、5、12、14号染色体上,邻近或座落于SPRY2、NDFIP2、ITGA9、EMC2、TMEM17、EHBP1、SCAF8、TIAM2、HTT、STON2、PRKCD、RBBP6、TNRC6A、MAPK8IP3基因上.[结论]通过GWAS分析发现10个SNP位点可能与白耳黄鸡三叉冠性状相关.研究结果将为白耳黄鸡的育种提供候选分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路.
文献关键词：
全基因组关联分析;单核苷酸多态性;常染色体遗传;种蛋受精率;鸡冠型
中图分类号：
作者姓名：
张文武;邱峰芳;许继国
作者机构：
东华理工大学化学生物与材料科学学院,江西南昌 330013;南昌师范学院生物技术研究所/江西地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌 330029
文献出处：
引用格式：
[1]张文武;邱峰芳;许继国-.白耳黄鸡三叉冠性状分析)[J].广东农业科学,2022(12):118-123
A类：
三叉冠,SPRY2,NDFIP2,ITGA9,EMC2,TMEM17,EHBP1,SCAF8,TIAM2,STON2,RBBP6,TNRC6A,MAPK8IP3,鸡冠型
B类：
黄鸡,性状分析,选单,单核苷酸多态性,Single,Nucleotide,Polymorphisms,SNP,杂交试验,血样,抽提,Illumina,基因型,PLINK,质控,GEMMA,全基因组关联分析,Genome,wide,Association,Analysis,GWAS,常染色体遗传,种蛋受精率,鸡群,群体内,座落,落于,HTT,PRKCD,育种,分子标记,地方鸡,标记辅助选择
AB值：
0.251861
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