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典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探讨鬼针草对结肠炎的治疗作用及机制研究
文献摘要:
利用网络药理学方法,研究鬼针草(Bidens pilosa L.)治疗结肠炎的潜在药效物质基础和分子机制,为其后续体内外基础研究提供一定的理论依据.通过TCMSP数据库检索鬼针草化学成分;结合PubChem数据库和Chemicaldraw软件获得化合物SDF格式文件,并在SwissTarget Pre-diction对化合物进行靶点预测;通过GeneCards数据库查询结肠炎的相关靶点;借助Uniprot数据库;使靶点的蛋白和基因信息标准化;制作分子预测靶点和疾病靶点韦恩图,获得交集基因;借助String数据库,筛选核心靶点,使用Cytoscape3.7.2软件构建成分靶点图和PPI网络互助图.再通过Metascape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析.TCMSP数据库筛选到OB≥30且DL≥0.18的活性成分6个,SwissTarget Prediction靶点预测,去除重复靶点后剩下137个靶点,GeneCards数据库获得疾病靶点203个,共有靶点19个.Metascape数据库GO富集分析得到29个条目(P<0.05),KEGG通路富集得到相关通路5条(P<0.05).最后使用分子对接技术对核心化合物与关键靶点进行对接验证.结果表明,鬼针草治疗结肠炎的通路主要涉及癌症相关途径和端粒蛋白调节通路.同时鬼针草中含有的槲皮素(quercetin)和木犀草素(luteolin)可能为其治疗疾病的核心活性化合物.
文献关键词:
鬼针草;结肠炎;网络药理学;槲皮素;木犀草素
作者姓名:
赖奇;庄敏;杨春菊;马燕华;易春蝶;王蔷
作者机构:
云南民族大学 民族药资源化学国家民委-教育部重点实验室,云南 昆明650500;文山学院 冶金与材料学院,云南 文山663099
引用格式:
[1]赖奇;庄敏;杨春菊;马燕华;易春蝶;王蔷-.基于网络药理学和分子对接技术探讨鬼针草对结肠炎的治疗作用及机制研究)[J].云南民族大学学报(自然科学版),2022(06):680-688
A类:
Chemicaldraw
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,鬼针草,结肠炎,治疗作用,利用网络,Bidens,pilosa,潜在药效物质,药效物质基础,体内外,TCMSP,数据库检索,草化,PubChem,SDF,格式文件,SwissTarget,靶点预测,GeneCards,数据库查询,Uniprot,基因信息,信息标准,韦恩图,交集,String,核心靶点,Cytoscape3,软件构建,PPI,网络互助,Metascape,功能富集分析,通路富集分析,OB,DL,活性成分,Prediction,剩下,条目,相关通路,关键靶点,相关途径,端粒,调节通路,槲皮素,quercetin,木犀草素,luteolin,活性化合物
AB值:
0.388948
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