典型文献
基于生物信息学的糖尿病脑病关键基因与通路筛选及中药预测的研究
文献摘要：
目的:基于生物信息学方法对糖尿病脑病(DE)的关键基因进行初步筛选,探索与其相关的潜在靶点、生物过程及通路,进而预测治疗DE的潜在中药.方法:运用GEO数据库筛选出基因芯片原始数据集GSE161355作为样本进行研究.基于R Studio软件的质量评估和差异分析筛选差异基因,应用DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,利用Cytoscape软件进行关键靶点筛选及关键功能模块构建、可视化.通过将关键靶点与Coremine Medical数据库相互映射,筛选治疗DE的潜在中药.结果:通过对GSE161355基因原始数据集的预处理,从DE患者中筛选出326个显著性差异基因,差异基因主要参与学习、记忆、神经元突触传递、细胞分裂、蛋白质分泌、血管生成调节等生物过程,与神经活性配体-受体信号通路、细胞周期通路等存在关联.蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络显示MCHR2、CXCR2、GNAI1、P2RY13、NPY1R、C3、LPAR4、OXTR、CHRM5、CDC7、ORC5、ORC4、CCNA1可作为治疗DE的潜在靶点,多方位、多维度、多层面参与炎症反应、细胞凋亡、内质网应激、血管生成等生物过程.通过中药预测筛选发现人参、熟地黄、西红花、银杏叶、黄连、郁金等可作为潜在来源.结论:通过对显著性差异基因和潜在核心靶点的分析促进了对DE发病机制的进一步理解和探索,为今后治疗和评估提供了新的方向和临床依据.
文献关键词：
生物信息学;糖尿病;脑病;糖尿病脑病;差异基因;作用机制;中医治疗;中药预测
中图分类号：
作者姓名：
石崯力;王旭
作者机构：
南京中医药大学第一临床医学院/南京中医药大学附属医院,南京,210029
文献出处：
引用格式：
[1]石崯力;王旭-.基于生物信息学的糖尿病脑病关键基因与通路筛选及中药预测的研究)[J].世界中医药,2022(08):1057-1063
A类：
GSE161355,MCHR2,GNAI1,P2RY13,LPAR4
B类：
糖尿病脑病,关键基因,中药预测,生物信息学方法,DE,初步筛选,潜在靶点,生物过程,GEO,基因芯片,原始数据,Studio,质量评估,差异基因,DAVID,基因本体,富集分析,京都基因和基因组百科全书,Cytoscape,关键靶点,靶点筛选,功能模块,Coremine,Medical,互映,参与学习,突触传递,细胞分裂,蛋白质分泌,血管生成,细胞周期通路,存在关联,蛋白质相互作用,PPI,CXCR2,NPY1R,C3,OXTR,CHRM5,CDC7,ORC5,ORC4,CCNA1,多方位,多层面,内质网应激,熟地黄,西红花,银杏叶,黄连,郁金,潜在来源,核心靶点,中医治疗
AB值：
0.37624
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