典型文献
腊肠树叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析
文献摘要：
目的 获取腊肠树(Cassia fistula L.)叶绿体基因组信息特征,对其在决明属(Cassia Linn.)中的系统发育位置进行研究,为腊肠树有效的开发、保护和利用提供理论依据.方法 使用Illumina测序技术对腊肠树进行测序,并结合生物信息学方法对其进行叶绿体基因组组装、注释和系统发育分析.结果 腊肠树叶绿体基因组长度为161,724 bp,具有典型的四分体结构,总GC含量为36.1％,包含128个基因,其中83个蛋白质编码基因,37个tRNA基因和8个rRNA基因.系统发育分析表明,7个决明属物种被聚为3支,美丽决明S.spectabilis、望江南S.occidentalis、铁刀木S.siamea和决明S.tora聚为一支,腊肠树C.fistula与布鲁斯特决明C.brewsteri聚为一支,山扁豆Chamaecrista mimosoides单独聚为一支,且腊肠树与布鲁斯特决明C.brewsteri的亲缘关系最近.结论 从叶绿体基因组系统发育的角度来看,本研究支持2010版的Flora of China的决明亚族植物种类的划分结论,决明属物种中的美丽决明S.spectabilis、望江南S.occidentalis、铁刀木S.siamea和决明S.tora应归为番泻决明属(Senna),腊肠树C.fistula应归为决明属(Cassia),山扁豆Ch.mimosoide应归为山扁豆属(Chamaecrista).
文献关键词：
腊肠树;叶绿体基因组;决明属;系统发育;分子鉴定;传统药物
中图分类号：
作者姓名：
向如双;段宝忠;孙伟;宋驰;王艳;Atia tul Wahab;孟祥霄
作者机构：
671000 大理大学药学院;中国中医科学院中药研究所;中国中医科学院中药生物技术中心;中国中医科学院中药数据中心;成都中医药大学本草基因组学研究院;卡拉奇大学国际化学与生命科学研究院化学研究所;卡拉奇大学国际化学与生命科学研究院分子医学与药物研究所
文献出处：
引用格式：
[1]向如双;段宝忠;孙伟;宋驰;王艳;Atia tul Wahab;孟祥霄-.腊肠树叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析)[J].环球中医药,2022(12):2266-2274
A类：
决明属,siamea,tora,brewsteri,mimosoides,mimosoide
B类：
腊肠树,树叶,叶绿体基因组,基因组序列,序列特征,系统发育分析,Cassia,fistula,基因组信息,信息特征,Linn,保护和利用,Illumina,生物信息学方法,基因组组装,组长,bp,四分体,分体结构,蛋白质编码基因,tRNA,rRNA,spectabilis,望江南,occidentalis,铁刀木,布鲁斯,扁豆,Chamaecrista,亲缘关系,研究支持,Flora,China,植物种类,番泻,Senna,分子鉴定,传统药物
AB值：
0.23612
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