典型文献
拟南芥PAL基因家族鉴定及表达模式分析
文献摘要：
为研究苯丙氨酸解氨酶(PAL)作为苯丙烷类代谢途径的关键酶,在植物响应环境胁迫过程中的重要作用,本研究利用HMMER、Pfam与SMART等工具,从拟南芥全基因组中筛选获得9个PAL成员,分析其编码酶蛋白的理化性质、二级结构与保守基序等信息.同时,结合转录组与定量PCR分析PAL成员在干旱与盐胁迫条件下的表达模式.结果表明,拟南芥PAL成员的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;亮氨酸和丙氨酸为含量较高的氨基酸残基;拟南芥PAL成员含有20种不同的保守基序,其中motif6含有ASG活性位点,为所有PAL成员所共有;较多PAL成员具有光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的顺式调控元件.转录组学与定量PCR分析发现,A T3G53260.1、A T3G53260.2与A T3G47660.1的mRNA表达水平在干旱与盐胁迫后发生显著变化,推测这3条基因可能参与拟南芥对干旱及盐胁迫的响应过程,表明PAL基因在调控植物生长发育与非生物胁迫响应过程中发挥重要作用.
文献关键词：
拟南芥;苯丙氨酸解氨酶;基因家族;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
秦余;田春尧;赵咏洋;黄思沛;宋思敏;廖海
作者机构：
西南交通大学生命科学与工程学院,成都610031
文献出处：
引用格式：
[1]秦余;田春尧;赵咏洋;黄思沛;宋思敏;廖海-.拟南芥PAL基因家族鉴定及表达模式分析)[J].四川大学学报（自然科学版）,2022(06):166-172
A类：
T3G53260,T3G47660,干旱及盐胁迫
B类：
拟南芥,PAL,基因家族鉴定,表达模式分析,苯丙氨酸解氨酶,苯丙烷,代谢途径,关键酶,环境胁迫,研究利用,HMMER,Pfam,SMART,全基因组,二级结构,保守基序,胁迫条件,无规则,卷曲,亮氨酸,氨基酸残基,motif6,ASG,活性位点,光响应,激素响应,胁迫响应,顺式调控元件,转录组学,响应过程,植物生长发育,非生物胁迫,生物信息学分析
AB值：
0.296357
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