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典型文献
黄精转录组特性分析及相关功能基因研究
文献摘要:
分析黄精转录组数据,挖掘与黄精中多糖、皂苷元、黄酮生物合成途径相关的关键酶基因.利用Illumina HiSeq测序平台对黄精全株进行转录组测序,对测序结果进行注释分析.共获得146072个有效转录本,超过51.00%的转录本在NR、Swiss-Prot、KOG、GO、KEGG数据库中获得注释.β-呋喃果糖苷酶、己糖激酶等参与了黄精多糖的生物合成;UDP-葡萄糖基转移酶、β-葡萄糖苷酶等参与黄精皂苷元的生物合成途径;查尔酮异构酶、查尔酮合成酶等参与黄精内黄酮的生物合成途径.初步获得黄精中参与黄精多糖、皂苷元、黄酮生物合成的候选关键酶基因,为进一步研究黄精的生理生化代谢奠定了基础.
文献关键词:
黄精;转录组;多糖;皂苷;黄酮
作者姓名:
王宇;谭福燕;张利萍;何玉丰;范建辉;李旺;彭柿杰;邱庆华
作者机构:
攀枝花学院附属医院,四川攀枝花617000;攀枝花学院医学院,四川攀枝花617000;攀枝花学院康养学院,四川攀枝花617000
引用格式:
[1]王宇;谭福燕;张利萍;何玉丰;范建辉;李旺;彭柿杰;邱庆华-.黄精转录组特性分析及相关功能基因研究)[J].四川师范大学学报(自然科学版),2022(01):103-109
A类:
果糖苷酶
B类:
相关功能,功能基因,基因研究,转录组数据,皂苷元,黄酮,生物合成途径,关键酶基因,Illumina,HiSeq,测序平台,全株,转录组测序,共获,转录本,NR,Swiss,Prot,KOG,呋喃,己糖激酶,黄精多糖,UDP,糖基转移酶,葡萄糖苷酶,黄精皂苷,查尔酮异构酶,查尔酮合成酶,内黄,选关,生理生化
AB值:
0.324897
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