典型文献
CXCL1/2/10介导的免疫炎症与草酸钙结石形成的关系
文献摘要:
目的:探讨CXC趋化因子配体1、2、10(CXCL1/2/10)等炎症诱导因子的差异分布及其介导的免疫炎症与草酸钙结石形成的关系.方法:首先在GEO数据库中进行数据检索,获得高钙尿大鼠的mRNA测序矩阵后,对其进行差异基因分析;对获得的差异基因进行GO与KEGG的功能富集分析;对获得的差异基因进行蛋白互作分析(PPI)进而筛选关键分子;通过饲喂1%乙二醇与灌胃1%的氯化铵构建草酸钙结石的大鼠模型,并进行HE染色验证模型;在草酸钙结石大鼠的肾组织切片中进行免疫组化实验,以验证关键分子的表达水平.结果:基于GEO数据共获得195个差异表达基因,其中上调146,下调49(P<0.05,log2FC<-1或log2 FC>1);基于Metascape数据库得出的GO与KEGG分析显示,基因富集在GO:0032496:对脂多糖的反应、GO:0010942:细胞死亡的正调控、GO:0002544:慢性炎症反应、GO:0006954:炎症反应、GO:0072593:活性氧代谢过程等代谢通路中;PPI蛋白互作分析结合功能富集分析最终确定5个关键基因,即CXCL1、CX-CL2、CXCL10、IL6、IL1 B;HE染色结果显示草酸钙结石大鼠模型构建成功,且免疫组化显示5个关键分子在造模组中均升高,差异具有统计学意义(P<0.05),其中CXCL1/2/10表达明显升高(P<0.001).结论:基于生物信息学分析与实验验证,CXCL1/2/10在草酸钙结石大鼠肾组织中表达明显升高,可能与免疫炎症相关,提示CXCL1/2/10可成为缓解草酸钙结石患者肾组织免疫炎症进而达到治疗效果的潜在分子靶点.
文献关键词:
GEO数据库;草酸钙结石;CXC趋化因子配体;免疫炎症;大鼠
中图分类号:
作者姓名:
刘文刚;张光远;黎明;程祎;吴志荣;孔广发;莫永轩
作者机构:
东莞市滨海湾中心医院 泌尿外科,广东 东莞 523000;东南大学附属中大医院 泌尿外科,江苏 南京 210009
文献出处:
引用格式:
[1]刘文刚;张光远;黎明;程祎;吴志荣;孔广发;莫永轩-.CXCL1/2/10介导的免疫炎症与草酸钙结石形成的关系)[J].东南大学学报(医学版),2022(03):402-407
A类:
B类:
免疫炎症,草酸钙结石,趋化因子配体,诱导因子,GEO,数据检索,高钙,差异基因分析,功能富集分析,蛋白互作分析,PPI,选关,关键分,饲喂,乙二醇,灌胃,氯化铵,大鼠模型,HE,验证模型,肾组织,组织切片,免疫组化,化实验,共获,差异表达基因,log2FC,Metascape,基因富集,脂多糖,细胞死亡,正调控,慢性炎症反应,活性氧代谢,代谢过程,代谢通路,关键基因,CL2,CXCL10,IL6,IL1,染色结果,模组,生物信息学分析,组织中表达,分子靶点
AB值:
0.25749
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