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基于2b-RAD技术分析白化茶树品种(系)遗传多样性
文献摘要:
为揭示白化茶树品种(系)的遗传多样性,利用简化基因组测序技术(2b-restriction site-associated DNA,2b-RAD)对23份茶树种质(20份白化,3份常绿对照)进行测序,分析其遗传多样性、亲缘关系和群体结构.结果表明,共获得576 193 750条高质量测序数据和56 498个高质量SNPs.系统发育树和主成分分析表明,23份种质可分为3个类群,类群 Ⅰ为1份来自贵州的大叶种,类群Ⅱ包含来自贵州的地方种质6份,类群Ⅲ包含来自浙江的14份种质和来自安徽、福建的2份种质.基于系统发育树,3个类群的遗传多样性参数均表现为:类群 Ⅰ>类群Ⅱ>类群Ⅲ,类群 Ⅰ和类群Ⅱ、类群Ⅲ之间分别呈现中、高度的遗传分化水平.综上所述,白化茶树品种(系)存在中、高度的遗传分化,不同地理来源的种质间遗传分化更大,为白化茶树种质鉴定、资源利用和育种等提供了理论依据.
文献关键词:
白化茶树;2b-RAD;SNP;遗传多样性
中图分类号:
作者姓名:
刘声传;许应芬;魏杰;鄢东海;陈智雄;徐霖;刘燕;周玉锋
作者机构:
贵阳学院生物与环境工程学院,贵阳550005;贵州省农业科学院茶叶研究所,贵阳550006
文献出处:
引用格式:
[1]刘声传;许应芬;魏杰;鄢东海;陈智雄;徐霖;刘燕;周玉锋-.基于2b-RAD技术分析白化茶树品种(系)遗传多样性)[J].中国农业科技导报,2022(08):65-73
A类:
B类:
2b,RAD,白化茶树,茶树品种,简化基因组测序技术,restriction,site,associated,树种,常绿,亲缘关系,群体结构,共获,序数,SNPs,系统发育树,类群,地方种质,遗传多样性参数,参数均,遗传分化,综上所述,地理来源,种质鉴定,育种
AB值:
0.267435
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