典型文献
板栗总苞和坚果主要性状与SSR标记的关联分析
文献摘要：
[目的]通过测定113份板栗品种(系)的数量、质量和假质量性状,分析其遗传变异,比较不同组群之间的性状差异,将SSR标记与性状进行关联,获得更多与SSR标记显著关联的性状,挖掘优异的等位变异位点,为开展板栗分子辅助育种的研究提供参考.[方法]测定并分析板栗总苞和坚果的38个数量、质量和假质量性状,利用SPSS和Graphpad软件对数量性状进行差异显著性和相关性分析,基于SSR标记进行遗传多样性分析,最后用TASSEL 2.1软件通过一般线性模型(general linear model,GLM)和混合线性模型(mixed linear model,MLM)分别对性状和标记进行关联分析.[结果]在遗传多样性分析中,21对SSR引物的有效等位基因数(Ne)、Shannon指数(Ⅰ)、多态性信息含量(PIC＞0.5)、观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为3.164、1.269、0.589、0.593和0.635.根据群体结构分析分为2个主要组群,为了更好地比较性状差异,在聚类分析时将中间类型的品种单独划分为一组.在质量和假质量性状分析中,多样性指数变化范围为0.139-1.567,遗传多样性最高的性状是坚果光泽,最低的是底座接线;坚果形状、光泽、颜色等性状组群间频率分布差异明显.在数量性状分析中,变异系数的范围在3.96％-36.31％,苞重、总苞重和单粒重的变异系数均在30％以上,遗传变异程度高;果形指数和含水量变异系数均在10％以下,具有稳定的遗传特性;总苞和坚果的外观性状之间有强相关性,相关系数均在0.6以上;组1-组2和组2-组3在果实形状和重量中存在显著差异(P＜0.05).在关联分析中,GLM模型中有13个标记位点与18个表型性状极显著关联,表型变异解释率范围为15.12％-54.99％;MLM模型中有6个标记位点与7个表型性状极显著关联,表型变异解释率范围在8.66％-26.93％.[结论]本研究将SSR标记与表型性状进行关联分析,共发现13个标记位点与坚果单粒重等20个表型性状极显著关联,为开展板栗分子辅助育种的研究奠定了基础.
文献关键词：
板栗;性状;SSR;遗传多样性;关联分析
中图分类号：
作者姓名：
陈旭;郝雅琼;聂兴华;杨海莹;刘松;王雪峰;曹庆芹;秦岭;邢宇
作者机构：
北京农学院植物科学技术学院,北京102206;龙潭林场,江苏溧阳213300
文献出处：
引用格式：
[1]陈旭;郝雅琼;聂兴华;杨海莹;刘松;王雪峰;曹庆芹;秦岭;邢宇-.板栗总苞和坚果主要性状与SSR标记的关联分析)[J].中国农业科学,2022(13):2613-2628,中插4-中插8
A类：
B类：
坚果,主要性状,SSR,板栗品种,质量性状,遗传变异,组群,等位变异,变异位点,展板,分子辅助育种,Graphpad,数量性状,遗传多样性分析,TASSEL,一般线性模型,general,linear,model,GLM,混合线性模型,mixed,MLM,引物,等位基因,Ne,Shannon,多态性信息含量,PIC,杂合度,Ho,He,群体结构分析,中间类型,性状分析,多样性指数,变化范围,光泽,底座,接线,频率分布差异,粒重,果形指数,遗传特性,外观性状,强相关性,果实形状,表型性状,表型变异
AB值：
0.333553
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