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7株鸡滑液囊支原体四川分离株全基因组分析
文献摘要：
旨在了解滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)遗传多样性,本研究对7株MS四川分离株进行全基因组测序及生物信息学分析.采用Illumina HiSeq平台和PE文库结合方式全基因组测序,运用各数据库注释,用MEGAX软件将7株MS与NCBI收录的8株MS全基因比较.结果 显示,分离自同一鸡场的4株MS分离株MS251、MS254、MS221、MS231的基因数、种类、毒力因子数相同或差异小,而分离自3个不同鸡场的MS分离株MS12H、MS1G、MSK1的基因数、毒力因子数存在较大差异;将该7株MS四川分离株与NCBI公布的8株MS分离株比较圈图,发现四川分离株与巴西MS53、美国WVU-1853、澳大利亚86079/7 NS,以及疫苗株MS-H差异较大,而与河南HN01最相近.不同场间和同场间四川分离株都存在遗传多样性.本研究为研究MS分离株的致病机制、开发MS亚单位疫苗和建立特异性检测方法提供了理论依据.
文献关键词：
鸡滑液囊支原体;全基因组;预测结果;进化分析;线性分析
中图分类号：
作者姓名：
刘丽佳;王誉;张焕容;王嘉博
作者机构：
西南民族大学畜牧兽医学院,成都610041
文献出处：
引用格式：
[1]刘丽佳;王誉;张焕容;王嘉博-.7株鸡滑液囊支原体四川分离株全基因组分析)[J].畜牧兽医学报,2022(02):505-519
A类：
MS251,MS254,MS221,MS231,MS12H,MS1G,MS53,WVU,HN01
B类：
鸡滑液囊支原体,分离株,全基因组分析,Mycoplasma,synoviae,遗传多样性,全基因组测序,生物信息学分析,Illumina,HiSeq,PE,文库,结合方式,MEGAX,NCBI,鸡场,毒力因子,MSK1,圈图,巴西,NS,疫苗株,同场,致病机制,亚单位疫苗,特异性检测,进化分析,线性分析
AB值：
0.245941
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