典型文献
广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析
文献摘要：
萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率.为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种,本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率,筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种.同时,以低温萌发比率为表型数据和高密度的SNP标记为基因型数据,利用全基因组关联分析鉴定到11个水稻低温萌发QTLs.其中qLTG2-1、qLTG7-1、qLTG7-2和qLTG10-1与前人定位的水稻低温萌发QTL共定位.qLTG11-1是本研究新鉴定的最显著的水稻低温萌发QTL.利用RNA-seq和qRT-PCR对其进行候选基因预测和验证,发现在低温萌发期间,qLTG11-1 区间内的LOC_Os11g07020在低温萌发比率高和低的品种中有不同的表达模式.LOC_Os11g07020编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶同工酶,可能通过调控糖酵解反应而影响水稻萌发期耐冷性.本研究筛选到多份耐冷性强的水稻品种,并找到可能调控水稻萌发期耐冷性的候选基因,可为培育萌发期耐冷性强的水稻品种提供参考.
文献关键词：
水稻;低温萌发;果糖-1;6-二磷酸醛羧酶;全基因组关联分析
中图分类号：
作者姓名：
丁杰荣;孙炳蕊;于航;江立群;张静;吕树伟;陈文丰;范芝兰;潘大建;李晨;刘清
作者机构：
广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室,广州510640
文献出处：
引用格式：
[1]丁杰荣;孙炳蕊;于航;江立群;张静;吕树伟;陈文丰;范芝兰;潘大建;李晨;刘清-.广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析)[J].植物遗传资源学报,2022(05):1425-1437
A类：
qLTG2,qLTG7,qLTG10,qLTG11,Os11g07020
B类：
核心种质,全基因组关联分析,萌发期,耐冷性,响水,水稻直播,成苗率,水稻品种,种质资源,低温萌发,发比,SNP,记为,基因型,分析鉴定,QTLs,人定,共定位,seq,qRT,候选基因预测,LOC,表达模式,果糖,二磷酸,羧酶,同工酶,糖酵解,多份,控水
AB值：
0.188872
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
