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典型文献
春小麦主要籽粒性状的全基因组关联分析
文献摘要:
为挖掘控制春小麦主要籽粒性状的关联SNP及候选基因,以国外引进品种、新疆地方品种、新疆自育品种共298份春小麦品种为材料,利用小麦55K SNP芯片,对5个环境下小麦千粒重、粒长、粒宽3个主要籽粒性状进行基于Q+K混合线性模型(mixed linear model,MLM)的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).结果表明,供试小麦品种的3个主要籽粒性状在5个环境下的变异系数为3.89%~19.77%,其中粒宽的变异幅度最小,千粒重的变异幅度最大.不同环境中,新疆育成品种的3个主要籽粒性状的平均值均最高,而新疆地方品种的3个籽粒性状的平均值均最低.GWAS结果表明,共检测到84个与小麦主要籽粒性状显著关联的稳定SNP位点,它们分布在小麦的21条染色体上,单个SNP位点可解释3.74%~11.18%的表型变异.在1B、2B、3B、4B、5A、5D染色体上检测到6个同时关联多个籽粒性状的稳定位点.对84个SNP位点进行候选基因筛选,筛选到6个可能与小麦主要籽粒性状相关的候选基因,可作为小麦籽粒研究的重要基因.
文献关键词:
小麦;籽粒性状;全基因组关联分析;SNP;候选基因
作者姓名:
严勇亮;张恒;张金波;时晓磊;耿洪伟;肖菁;路子峰;倪中福;丛花
作者机构:
中国农业大学农学院,北京100193;新疆农业科学院农作物品种资源研究所,新疆乌鲁木齐830091;新疆农业科学院国际科技合作交流处,新疆乌鲁木齐830091;新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室,新疆乌鲁木齐830052
文献出处:
引用格式:
[1]严勇亮;张恒;张金波;时晓磊;耿洪伟;肖菁;路子峰;倪中福;丛花-.春小麦主要籽粒性状的全基因组关联分析)[J].麦类作物学报,2022(10):1182-1191
A类:
Q+K
B类:
春小麦,籽粒性状,全基因组关联分析,SNP,引进品种,地方品种,自育,小麦品种,55K,千粒重,粒长,混合线性模型,mixed,linear,model,MLM,genome,wide,association,study,GWAS,不同环境,育成品种,可解释,表型变异,1B,2B,3B,4B,5A,5D,稳定位点,候选基因筛选,小麦籽粒
AB值:
0.287335
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