典型文献
黄麻内参基因筛选及次生细胞壁合成相关基因的表达分析
文献摘要：
选择合适的内参基因进行校正和标准化,既能提高实时定量荧光PCR的准确性,也为分析黄麻次生细胞壁合成相关基因的表达模式奠定基础.本研究通过常用的内参基因,结合课题组已有的基因组数据和转录组数据,初步筛选出8个内参基因(CcTUBα、CcACT、CcDnaJ、CcTUBβ、CcUBQ、CcEF1α、CcUBC和CcUBI).为验证这些候选内参基因的稳定性,以优良品种'黄麻179'为材料,对种子萌发后14 d的根、茎、叶进行qRT-PCR分析.经Ct值的变异系数、软件geNorm和NormFinder的综合分析,确定表达最稳定内参基因为CcDnaJ,最佳内参基因组合方式为CcDnaJ+CcUBQ+CcUBI.通过种子萌发后10 d下胚轴、60 d和90 d茎皮的转录组数据分析次生细胞壁合成相关基因的表达模式,发现木质素合成基因Cc4CL1、CcCCoAOMT1的表达量在种子萌发后60 d茎皮最高,而种子萌发后90 d茎皮表现为下降;纤维素合成酶基因CcCesA4、CcCesA7、CcesA8和木聚糖合成基因CcIRX8、CcIRX9、CcFRA8的表达量在种子萌发后10 d下胚轴最高,而种子萌发后60 d、90 d茎皮的表达量均有下降,表明这些基因参与了黄麻纤维发育.以CcDnaJ+CcUBQ+CcUBI作为内参基因组合,qRT-PCR分析5个次生细胞壁合成相关基因,即Cc4CL1、CcCCoAOMT1、CcCesA4、CcCesA7、CcesA8,在种子萌发后7 d下胚轴和14 d茎的表达模式,发现这5个基因在种子萌发期后14 d茎的表达量均高于种子萌发期后7 d下胚轴,暗示着黄麻纤维的形成开始于7～14 d之间,同时表明CcDnaJ+CcUBQ+CcUBI的内参基因组合具有实用性.
文献关键词：
黄麻;qRT-PCR;内参基因;次生细胞壁;纤维素;木质素
中图分类号：
作者姓名：
杨昕;李玉;刘传兵;张力岚;何青垚;祁建民;张立武
作者机构：
福建农林大学农学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室,福建福州 350002;福建农林大学农业农村部东南黄红麻实验观测站/福建省麻类种质资源共享平台/福建省南方经济作物遗传育种与多用途开发国际科技合作基地,福建福州 350002;恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北恩施 445000
文献出处：
引用格式：
[1]杨昕;李玉;刘传兵;张力岚;何青垚;祁建民;张立武-.黄麻内参基因筛选及次生细胞壁合成相关基因的表达分析)[J].作物学报,2022(07):1614-1624
A类：
CcTUB,CcACT,CcDnaJ,CcUBQ,CcEF1,CcUBC,CcUBI,CcDnaJ+CcUBQ+CcUBI,Cc4CL1,CcCCoAOMT1,CcCesA4,CcCesA7,CcesA8,CcIRX8,CcIRX9,CcFRA8
B类：
内参基因,基因筛选,次生细胞壁,表达分析,高实时,实时定量,表达模式,基因组数据,转录组数据,初步筛选,优良品种,叶进,qRT,Ct,geNorm,NormFinder,基因组合,组合方式,下胚轴,木质素,纤维素合成酶基因,木聚糖,黄麻纤维,纤维发育,种子萌发期,暗示着
AB值：
0.146325
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