典型文献
热应激应答过程中酪蛋白来源的环状RNA表达谱分析
文献摘要：
热应激会导致牛乳中酪蛋白含量减少,降低牛乳品质.本研究拟鉴定参与热应激应答的酪蛋白基因来源的环状RNA,为今后阐明热应激导致酪蛋白表达减少的分子机制提供理论依据.本课题组前期工作通过RNA-seq获取了环状RNA在非热应激及热应激奶牛(Bos taurus)乳腺组织中的表达数据.本研究随机挑选4个环状RNA,通过Sanger测序法验证了其反向剪接位点的存在;通过实时荧光定量PCR技术验证了其在非热应激及热应激组中的相对表达水平,所得结果与高通量测序分析结果一致.酪蛋白的编码基因包括αs1酪蛋白(casein alpha s1,CSN1S1)、αs2酪蛋白(CSN1S2)、β酪蛋白(casein beta,CSN2)以及κ酪蛋白(casein kappa,CSN3).通过统计分析环状RNA的宿主基因数据,分别统计了来源于各个编码基因的环状RNA,通过聚类热图及韦恩图展示了这些环状RNA在不同样本及不同组别中的表达模式.最后,通过RNA-seq的TPM(transcripts per million)数据分析了酪蛋白基因来源的环状RNA的相对表达水平.本研究鉴定出源于酪蛋白基因的环状RNA共52个,其中来源于CSN1S1、CSN1S2和CSN2的环状RNA种类分别为29、16和7个,未检测到来源于CSN3的环状RNA.这些环状RNA中,与非热应激组相比,显著上调的环状RNA有5种,其中3种在热应激条件下特异性表达.所鉴定的酪蛋白来源的环状RNA,在热应激应答过程中显著差异表达(P<0.05),可能参与了热应激应答过程的乳蛋白合成调控.本研究鉴定了热应激应答过程中酪蛋白来源的环状RNA差异表达谱,有助于阐明热应激导致牛乳中酪蛋白含量减少的分子机制,为提高牛乳品质提供了理论依据.
文献关键词：
环状RNA;热应激;牛乳;αs1酪蛋白(CSN1S1);αs2酪蛋白(CSN1S2);β酪蛋白(CSN2)
中图分类号：
作者姓名：
齐颖;解春艳;刑静;李秋玲
作者机构：
廊坊师范学院,生命科学学院/河北省动物多样性重点实验室/廊坊市细胞工程与应用研究重点实验室,廊坊065000
文献出处：
引用格式：
[1]齐颖;解春艳;刑静;李秋玲-.热应激应答过程中酪蛋白来源的环状RNA表达谱分析)[J].农业生物技术学报,2022(10):1926-1935
A类：
CSN1S2,CSN2
B类：
热应激,酪蛋白,表达谱分析,牛乳,蛋白含量,乳品质,前期工作,seq,奶牛,Bos,taurus,乳腺组织,Sanger,反向剪接,技术验证,相对表达,高通量测序分析,编码基因,s1,casein,alpha,CSN1S1,s2,beta,kappa,CSN3,宿主基因,基因数据,热图,韦恩图,组别,表达模式,TPM,transcripts,per,million,未检,特异性表达,差异表达,乳蛋白,蛋白合成,合成调控
AB值：
0.251772
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