典型文献
青海高原型牦牛SCD基因SNP及单倍型与生长性状的关联性分析
文献摘要：
硬脂酰辅酶A去饱和酶(stearyl-CoA desaturase,SCD)是牦牛(Bos grunniens)体内单不饱和脂肪酸(monounsaturated fatty acid,MUFA)生物合成的关键酶,对脂质合成和氧化的动态平衡调节过程有着重要的作用.为探索青海高原型牦牛SCD基因多态性及其与生长性状的关联性,通过DNA测序法进行基因的多态性分析,应用连锁不平衡分析和一般线性模型(general linear model,GLM)进行关联性分析.结果表明,SCD基因第3内含子上存在2个SNP(g.6614C>A和g.6660C>T),其中g.6614C>A上存在2种基因型,g.6660C>T上存在3种基因型;χ2检验表明,g.6614C>A处于哈代温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态,g.6660C>T处于不平衡状态,且g.6614C>A为低度多态(PIC<0.25),g.6660C>T为中度多态(0.50>PIC>0.25).与生长性状关联性分析发现,g.6614C>A位点上CA基因型的体重、体高、体斜长和管围显著高于CC基因型(P<0.05),而胸围与CC基因型差异不显著.g.6660C>T位点上TT基因型个体的体长与CT和CC基因型差异不显著,体重、体高和胸围显著高于CC和CT基因型(P<0.05),管围极显著高于CC基因型(P<0.01).单倍型和连锁不平衡分析发现2个位点存在4种单倍型,位点间不存在强连锁性(r2=0.027).组合单倍型分析发现,H1H3为最优组合单倍型.综上,SCD基因多态性与青海高原型牦牛的部分生长性状相关,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因,本研究为提高牦牛选种效率提供参考.
文献关键词：
高原型牦牛;硬脂酰辅酶A去饱和酶基因(SCD);DNA测序;生长性状
中图分类号：
作者姓名：
祁增源;高占红;周建强;韩银仓;刘秀;孙永刚
作者机构：
甘肃农业大学动物科学技术学院/甘肃省草食动物生物技术重点实验室,兰州730070;青海省畜牧兽医科学院,西宁810016
文献出处：
引用格式：
[1]祁增源;高占红;周建强;韩银仓;刘秀;孙永刚-.青海高原型牦牛SCD基因SNP及单倍型与生长性状的关联性分析)[J].农业生物技术学报,2022(07):1314-1320
A类：
高原型牦牛,6614C,6660C
B类：
青海高原,SCD,SNP,生长性状,关联性分析,硬脂,辅酶,去饱和,stearyl,CoA,desaturase,Bos,grunniens,不饱和脂肪酸,monounsaturated,fatty,acid,MUFA,生物合成,关键酶,脂质合成,动态平衡,平衡调节,基因多态性,多态性分析,连锁不平衡分析,一般线性模型,general,linear,model,GLM,内含子,基因型,哈代,温伯格,Hardy,Weinberg,不平衡状态,低度,PIC,性状关联,CA,CC,胸围,TT,体长,个位,连锁性,r2,单倍型分析,H1H3,最优组合,分生,分子标记辅助选择,候选基因,选种,酶基因
AB值：
0.323985
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