典型文献
长顺绿壳蛋鸡SLC8A1基因多态性及其对蛋壳品质的影响
文献摘要:
[目的]探究溶质载体家族8成员A1(solute carrier family 8 member A1,SLC8A1)基因多态性对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响,为今后改善蛋壳品质提供参考.[方法]根据GenBank数据库中鸡SLC8A1基因序列(登录号:NC_052534.1),使用Primer Premier 3.0软件设计引物进行PCR扩增,采用直接测序法筛选SLC8A1基因SNP位点,并利用SPSS 22.0软件检测SNP位点不同基因型蛋壳指标的差异.[结果]在SLC8A1基因外显子11上共发现 3 个新的 SNPs:g.16085681 T>C、g.16085766 C>T 和 g.16085781 T>C,共存在 3 种单倍型:H1(TCT)、H2(CTC)、H3(TTC),以及 6 种双倍型:H1H1(TTCCTT)、H1H2(TCTCTC)、H1H3(TTTCTC)、H2H2(CCTTCC)、H2H3(CTTTCC)、H3H3(TTTTCC).x2检验结果显示,3 个 SNPs 位点均处于 Hardy-Weinberg 平衡状态(P>0.05),均表现为中度多态.关联性分析结果显示,g.16085681 T>C位点TC基因型个体蛋壳强度显著高于 TT 基因型(P<0.05),g.16085681 T>C 位点和单倍型 H2(C16085681T16085766C16085781)对 SLC8A1 基因 mRNA二级结构产生明显的影响;g.16085766 C>T位点CC基因型个体蛋形指数显著高于TT基因型(P<0.05);双倍型H1H1、H1H3个体蛋形指数显著高于H2H3,H2H3个体蛋壳强度和蛋壳厚度均显著高于H1H3,H1H2、H2H2个体蛋重均显著高于H3H3(P<0.05).[结论]g.16085681 T>C位点可作为影响蛋壳强度的标记位点,g.16085766 C>T位点可作为影响蛋形指数的标记位点,双倍型H2H3可能是蛋壳强度和蛋壳厚度的有利双倍型.
文献关键词:
长顺绿壳蛋鸡;SLC8A1基因;多态性;蛋壳品质;关联分析
中图分类号:
作者姓名:
王盈童;杨酸;谭元成;王春源;张依裕
作者机构:
贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025
文献出处:
引用格式:
[1]王盈童;杨酸;谭元成;王春源;张依裕-.长顺绿壳蛋鸡SLC8A1基因多态性及其对蛋壳品质的影响)[J].中国畜牧兽医,2022(12):4688-4696
A类:
TTCCTT,TCTCTC,TTTCTC,CCTTCC,CTTTCC,H3H3,TTTTCC,C16085681T16085766C16085781
B类:
长顺绿壳蛋鸡,SLC8A1,基因多态性,蛋壳品质,溶质载体,solute,carrier,family,member,鸡蛋壳,GenBank,基因序列,登录号,NC,Primer,Premier,软件设计,引物,直接测序,不同基因型,外显子,SNPs,单倍型,双倍,H1H1,H1H2,H1H3,H2H2,H2H3,x2,Hardy,Weinberg,平衡状态,关联性分析,蛋壳强度,二级结构,蛋形指数,蛋壳厚度,蛋重
AB值:
0.246951
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