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灰葡萄孢bZIP家族基因的全基因组鉴定与表达规律分析
文献摘要:
bZIP(basic leucine zipper,bZIP)转录因子广泛存在于植物病原真菌中,在病菌的形态建成和侵染过程中起着重要的调控作用.灰葡萄孢(Botrytis cinerea)bZIP转录因子家族的系统研究少有报道.本研究利用生物信息学方法,在全基因组水平上对灰葡萄孢bZIP家族基因进行鉴定,并对其蛋白理化性质、系统进化关系、保守结构域及其在病菌分生孢子发育时期和侵染时期的表达规律进行分析.同时,利用qPCR技术,检测灰葡萄孢bZIP家族基因在NaCl、H2O2处理后的表达情况.结果发现,灰葡萄孢基因组中共包含16个bZIP家族基因,系统进化分析将其分为4个亚家族;灰葡萄孢bZIP家族基因均含有bZIP家族典型的BRLZ结构域,部分基因在分生孢子的不同发育和侵染时期上调表达,在NaCl和H2O2处理后显著下调表达,表明灰葡萄孢bZIP家族基因在病菌生长发育、侵染过程以及响应盐胁迫和氧化胁迫方面发挥重要的作用,本研究为阐明灰葡萄孢bZIP家族基因的功能及其作用机制提供了理论依据.
文献关键词:
灰葡萄孢;bZIP家族基因;生物信息学分析;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
李白;张子妍;张强;曹宏哲;藏金萍;张康;邢继红;董金皋
作者机构:
河北农业大学生命科学学院,保定071000;河北省植物生理与分子病理学重点实验室,保定071000;省部共建华北作物改良与调控国家重点实验室,保定071000;河北农业大学植物保护学院,保定07100
文献出处:
引用格式:
[1]李白;张子妍;张强;曹宏哲;藏金萍;张康;邢继红;董金皋-.灰葡萄孢bZIP家族基因的全基因组鉴定与表达规律分析)[J].农业生物技术学报,2022(04):762-771
A类:
B类:
灰葡萄孢,bZIP,家族基因,全基因组鉴定,表达规律,规律分析,basic,leucine,zipper,植物病原真菌,形态建成,侵染过程,Botrytis,cinerea,研究利用,利用生物,生物信息学方法,进化关系,保守结构域,分生孢子,发育时期,侵染时期,qPCR,NaCl,H2O2,系统进化分析,亚家族,BRLZ,盐胁迫,氧化胁迫,生物信息学分析,表达分析
AB值:
0.281168
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