典型文献
青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析
文献摘要：
为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性,选取93个青海小麦品种,基于55KSNP芯片对其进行全基因组扫描,并进行遗传多样性分析.结果共扫描到53 063个SNP位点,选择分型成功率(call rate,CR)≥0.90、缺失率＜10％、MAF＞0.05的SNP位点,获得多态性SNP位点50 243个,多态性比率为94.68％.其中多态性位点在第2同源群中分布最多,在第4同源群中分布最少,在基因组中分布呈现B＞A＞D,特别是4D染色体上的多态性SNP分布最少.93个小麦品种的多态性信息含量(PIC)为0.00～0.59,平均值为0.33,为中度多态性位点;两两品种间的遗传距离为0.00～0.67,平均值为0.41.通过聚类分析表明,根据遗传距离可将93个小麦品种划分为8个类群.综上,青海省现有小麦品种的遗传关系较近,需要引进外来品种来丰富青海省小麦品种的遗传多样性,推动小麦品种的选育及研究工作.
文献关键词：
青海省;小麦;55K SNP;遗传多样性
中图分类号：
作者姓名：
谢静敏;侯万伟;张小娟
作者机构：
青海大学生态环境工程学院,青海西宁810016;青海省农林科学院,青海西宁810016
文献出处：
引用格式：
[1]谢静敏;侯万伟;张小娟-.青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析)[J].麦类作物学报,2022(11):1343-1350
A类：
55KSNP
B类：
青海省,小麦品种,遗传多样性分析,遗传关系,全基因组扫描,描到,call,rate,CR,缺失率,MAF,性比率,多态性位点,4D,多态性信息含量,PIC,两品,种间,遗传距离,类群,选育
AB值：
0.233266
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