典型文献
基于生物信息学分析METTL7B在胶质瘤组织中的表达及其临床意义
文献摘要:
目的:探讨甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在胶质瘤组织中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性.方法:基于CGGA数据库胶质瘤数据和GTEx数据库正常脑组织数据,分析METTL7B基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用GEPIA数据库数据和免疫组织化学染色法进行验证.用Kaplan-Meier生存分析、单因素Cox分析、多因素Cox分析及ROC曲线分析等评估METTL7B在胶质瘤患者预后中的价值,用CGGA数据库数据分析METTL7B表达与胶质瘤患者临床病理特征的相关性,用CIBERSORT及TIMER数据库进行肿瘤免疫细胞浸润分析,进行KEGG通路富集分析及GO功能富集分析,通过基因共表达分析确定与METTL7B相关的基因.结果:METTL7B在胶质瘤组织中明显上调(均P<0.05),METTL7B表达是胶质瘤患者独立的不良预后因素.METTL7B高表达与高龄(>41岁)、肿瘤分级增加、肿瘤复发或继发性肿瘤、IDH野生型、1p19q非共缺失以及肿瘤的恶性病理学有关联(均P<0.01);METTL7B表达与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、单核细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、活化肥大细胞等免疫细胞有关联(均P<0.05).KEGG通路富集及GO功能分析结果显示,肿瘤相关信号通路及多种免疫反应在METTL7B高表达表型中显著富集.基因共表达分析结果表明,METTL7B与TNFRSF12A、CHI3L1、EMP3表达呈正相关(r=0.807、0.804、0.783,均P<0.01),与ELFN2、REPS2、SHANK2表达呈负相关(r=-0.642、-0.627、-0.602,均P<0.01).结论:METTL7B在胶质瘤组织中的表达上调是预后不良的指标,且与肿瘤免疫浸润相关.
文献关键词:
胶质瘤;甲基转移酶样蛋白7B;免疫浸润;生物标志物;预后
中图分类号:
作者姓名:
周杰;徐聃;李波;王首超;李欢;徐海波
作者机构:
武汉大学中南医院影像科,湖北武汉430071
文献出处:
引用格式:
[1]周杰;徐聃;李波;王首超;李欢;徐海波-.基于生物信息学分析METTL7B在胶质瘤组织中的表达及其临床意义)[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2022(01):55-62
A类:
TNFRSF12A,EMP3,ELFN2,REPS2
B类:
生物信息学分析,METTL7B,胶质瘤,甲基转移酶,临床病理特征,CGGA,GTEx,脑组织,表达差异,GEPIA,免疫组织化学染色法,Kaplan,Meier,生存分析,Cox,CIBERSORT,TIMER,肿瘤免疫细胞浸润,通路富集分析,功能富集分析,共表达,表达分析,不良预后,预后因素,肿瘤分级,肿瘤复发,继发性,IDH,野生型,1p19q,CD4+T,CD8+T,单核细胞,巨噬细胞,化肥,肥大细胞,功能分析,肿瘤相关,免疫反应,CHI3L1,SHANK2,预后不良,肿瘤免疫浸润,生物标志物
AB值:
0.252004
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