典型文献
禾谷炭疽菌中候选G蛋白偶联受体蛋白的找寻
文献摘要：
G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)是生物中一类具有典型七跨膜结构域的重要细胞表面受体,对细胞信号转导过程具有重要作用.禾谷炭疽菌严重危害着玉米、高粱等禾本科植物的产业发展,然而,对于该菌中GPCR蛋白数量及功能尚未有系统性报道.基于典型GPCR蛋白序列所具有的七跨膜保守结构域特征,通过TMHMM、Philius和TOPCONS 3种常用软件进行在线分析,明确全部蛋白的预测功能与蛋白数量、跨膜结构域数量与蛋白数量、氨基酸序列长度与蛋白数量之间的关系.结果表明,禾谷炭疽菌中含有243个具有七跨膜结构域蛋白(涉及含有7个跨膜结构域但不含有信号肽序列蛋白或者含有信号肽序列的具有8个跨膜结构域的蛋白),进一步通过SMART保守结构域分析,可知该菌中存在220个候选GPCR蛋白.该研究为进一步开展禾谷炭疽菌候选GPCR蛋白的理化性质解析提供了重要的数据支撑,也为进一步明确GPCR蛋白及其功能的研究奠定重要的理论基础.
文献关键词：
禾谷炭疽菌;七跨膜结构域;候选GPCR;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
喻红稠;韩长志
作者机构：
西南林业大学生物多样性保护学院,昆明650224;云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224
文献出处：
引用格式：
[1]喻红稠;韩长志-.禾谷炭疽菌中候选G蛋白偶联受体蛋白的找寻)[J].科学技术与工程,2022(01):103-109
A类：
禾谷炭疽菌,七跨膜结构域,Philius,TOPCONS
B类：
偶联,受体蛋白,找寻,protein,coupled,receptor,GPCR,细胞表面,细胞信号转导,严重危害,高粱,禾本科植物,保守结构域,TMHMM,常用软件,在线分析,预测功能,氨基酸序列,信号肽,肽序列,SMART,白及
AB值：
0.200128
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