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三维培养牙髓间充质细胞外泌体微小RNA表达谱分析
文献摘要：
目的 分析并比较二维(2D)与三维(3D)培养条件下人牙髓间充质细胞(DPSCs)外泌体(Exo)微小RNA(miRNA)的表达谱.方法 2D与3D条件下分别培养DPSCs,提取细胞Exo,采用透射电子显微镜、蛋白质免疫印迹及纳米颗粒追踪分析等方法观察并鉴定;通过高通量测序筛选差异表达miRNA,采用Dr.Tom系统及TargetScan网站进行生物信息学分析及组织再生修复相关靶基因预测.结果 3D培养下收集的DPSC-Exo均呈现"茶托样"双层膜结构,CD63和CD9表达阳性,粒径分布符合外泌体特征,与2D培养的DPSC-Exo一致.高通量测序共计检测外泌体来源miRNA 253个,其中3D组表达222个,特有表达99个;与2D组相比,表达显著差异60个[︱log2(3D/2D)︱≥1,Qvalue≤0.001].差异miRNA主要参与的生物学过程与分子功能分别为细胞过程和结合;京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析显示在代谢通路有显著富集.miR-302的候选靶基因有成纤维细胞生长因子(FGF)19和表皮生长因子受体等;miR-24-3p可能靶向神经元分化因子2、神经上皮细胞转化因子1、神经元分化因子1、神经元再生相关蛋白、FGF11、FGF结合蛋白3、FGF受体3、血小板衍生生长因子受体(PDGFR)β多肽、PDGFRα多肽、血管生成素、胰岛素样生长因子结合蛋白5等,以发挥组织再生修复功能.结论 相比2D培养,3D培养能调节DPSC-Exo部分miRNA表达量,上调一些与再生修复相关的miRNA,3D培养可考虑作为调节外泌体应用潜能的一种手段.
文献关键词：
三维培养;牙髓间充质细胞;外泌体测序;微小RNA
中图分类号：
作者姓名：
艾晓青;窦磊;乔新;杨德琴
作者机构：
重庆医科大学附属口腔医院牙体牙髓科 口腔疾病与生物医学重庆市重点实验室重庆市高校市级口腔生物医学工程重点实验室 重庆 401147
文献出处：
引用格式：
[1]艾晓青;窦磊;乔新;杨德琴-.三维培养牙髓间充质细胞外泌体微小RNA表达谱分析)[J].国际口腔医学杂志,2022(01):27-36
A类：
牙髓间充质细胞,Qvalue,神经元再生相关蛋白,FGF11
B类：
三维培养,细胞外泌体,表达谱分析,2D,培养条件,DPSCs,Exo,miRNA,透射电子显微镜,蛋白质免疫印迹,纳米颗粒追踪,差异表达,Dr,Tom,TargetScan,生物信息学分析,组织再生修复,复相,靶基因预测,茶托,双层膜,膜结构,CD63,CD9,表达阳性,粒径分布,log2,生物学过程,京都,基因组数据,通路富集分析,代谢通路,成纤维细胞生长因子,表皮生长因子受体,3p,神经元分化,神经上皮,上皮细胞,细胞转化,血小板衍生生长因子受体,PDGFR,多肽,血管生成素,胰岛素样生长因子结合蛋白,修复功能,可考,外泌体测序
AB值：
0.279496
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