典型文献
miR⁃135b⁃5p在口腔鳞状细胞癌中的表达及相关生物信息学分析
文献摘要：
目的 探索miR?135b?5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR?135b?5p靶基因并进行相关生物信息学分析.方法 通过肿瘤与癌症基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库分析miR?135b?5p在OSCC组织和癌旁组织中的表达并分析其临床意义;临床收集新鲜组织标本,采用实时荧光定量PCR验证不同组织中miR?135b?5p的表达情况.采用生物信息学方法预测miR?135b?5p的靶基因并进行通路富集分析.构建蛋白互作网络筛选关键靶基因.结果 OSCC组织中miR?135b?5p表达量较癌旁组织上调,差异有统计学意义(P<0.001);miR?135b?5p表达量对OSCC组织具有良好的诊断效能(AUC=0.960,P<0.001);OSCC组织中miR?135b?5p表达水平与组织病理分级相关(P=0.011);生信分析结果显示,miR?135b?5p的靶基因富集在与肿瘤相关的钙离子、cGMP?PKG、cAMP信号通路中;筛选得到10个关键靶基因:DLG2、ANK3、ERBB4、SCN2B、NBEA、GABRB2、ATP2B2、SNTA1、CACNA1D、SPTBN4.结论 miR?135b?5p可作为一种促癌基因参与OSCC的发生发展,并具有成为OSCC诊断标志物及治疗靶点的潜在应用价值.
文献关键词：
口腔鳞状细胞癌;微小RNA;miR-135b-5p;生物信息学;癌症基因组图谱;基因表达数据库;靶基因;钙离子信号通路;肿瘤分子标志物
中图分类号：
作者姓名：
赵格;黎昌学;郭超;朱慧
作者机构：
石河子大学医学院第一附属医院口腔科,新疆维吾尔自治区 石河子 832000
文献出处：
引用格式：
[1]赵格;黎昌学;郭超;朱慧-.miR⁃135b⁃5p在口腔鳞状细胞癌中的表达及相关生物信息学分析)[J].口腔疾病防治,2022(01):27-32
A类：
DLG2,SCN2B,NBEA,GABRB2,ATP2B2,SNTA1,SPTBN4
B类：
miR,135b,5p,口腔鳞状细胞癌,生物信息学分析,oral,squamous,cell,carcinoma,OSCC,癌旁组织,癌症基因图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,基因表达数据库,Gene,Expression,Omnibus,GEO,数据库分析,新鲜组织,组织标本,不同组织,生物信息学方法,通路富集分析,蛋白互作网络,选关,关键靶基因,诊断效能,病理分级,生信分析,基因富集,肿瘤相关,cGMP,PKG,cAMP,选得,ANK3,ERBB4,CACNA1D,促癌基因,诊断标志物,治疗靶点,潜在应用,癌症基因组图谱,钙离子信号通路,肿瘤分子标志物
AB值：
0.281805
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