典型文献
高通量测序技术筛选口腔扁平苔藓患者组织中microRNAs的差异表达谱及分析
文献摘要：
目的:通过高通量测序筛选口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)患者和正常人口腔黏膜组织中差异表达的微小RNA(miRNAs),探讨miRNAs在OLP发病机制中的作用.方法:收集3例就诊于河北医科大学第四医院口腔科的OLP患者病变组织(P组)和3例正常口腔黏膜组织(N组),进行illumina高通量测序,筛选差异表达的miRNAs,利用生物信息学分析对差异最显著的6个miRNA进行靶基因预测和功能富集分析.结果:应用DESeq软件,筛选出两组间差异表达的miRNAs共61个(|log2FoldChange|>1,P<0.05),其中表达上调的23个,下调的38个.选择上调(miR-449c-5p、miR-663b和miR-196a-5p)和下调(miR-133b、miR-1-3p和miR-133a-3 p)最显著的miRNA各3个进行靶基因预测,GO分析显示这些靶基因主要富集在细胞膜区域,可能参与了细胞迁移、分化、代谢和分泌调节等生物过程,KEGG分析显示这些靶基因显著富集在MAPK、Rap1、NF-κB、Ras等信号通路上.结论:OLP和正常口腔黏膜之间存在差异表达的miRNA,这些miRNA可通过SEMA3F、HECW1、POLDIP等靶基因作用于MAPK、NF-κB、Rap1等通路,参与OLP的发生发展.
文献关键词：
口腔扁平苔藓;高通量测序;微小RNA;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
刘健;李天翠;吴景景;姚曼曼;许彦枝;李京哲
作者机构：
河北医科大学第四医院口腔科 河北 石家庄 050011
文献出处：
引用格式：
[1]刘健;李天翠;吴景景;姚曼曼;许彦枝;李京哲-.高通量测序技术筛选口腔扁平苔藓患者组织中microRNAs的差异表达谱及分析)[J].口腔医学研究,2022(08):768-772
A类：
449c,HECW1,POLDIP
B类：
高通量测序技术,技术筛选,口腔扁平苔藓,患者组织,microRNAs,差异表达,表达谱,oral,lichen,planus,OLP,正常人,口腔黏膜,miRNAs,北医,口腔科,病变组织,illumina,利用生物,生物信息学分析,靶基因预测,功能富集分析,DESeq,log2FoldChange,5p,663b,196a,133b,3p,133a,细胞膜,细胞迁移,生物过程,MAPK,Rap1,Ras,SEMA3F
AB值：
0.314242
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
