典型文献
Lnc RNA TUC338影响人类宫颈癌细胞的蛋白组学分析
文献摘要:
目的 探究长链非编码RNATUC338影响人类宫颈癌细胞的分子机制.方法 将人类宫颈癌细胞Hela细胞分为实验组(TUC338 组)与对照组(rLV 组),分别感染 rLV-hTUC338-ZsGreen-Puro慢病毒及 rLV-ZsGreen-Puro 慢病毒,RT-PCR 检测两组细胞LncRNATUC338表达量,并对两组细胞进行蛋白质谱分析.结果 感染慢病毒后所有细胞均有绿色荧光显示,RT-PCR结果显示TUC338组Lnc RNA TUC338表达量较rLV组增加,两组均显示较多的蛋白条带;非标记定量法蛋白测序共检测到4323个蛋白.蛋白差异分析显示:与rLV组比较,在TUC338组中下调的蛋白有194个,上调的蛋白有225个.其中,重要的下调蛋白有:LAMB1、HNRNPH3、COX2等,上调蛋白有:EPPK1、ITPR1、AKR1C2等.最显著的下调GO为磷酸化修饰功能,上调GO为细胞骨架功能,最显著的下调KEGG通路为半乳糖代谢通路,上调KEGG通路为肌动蛋白细胞骨架调节通路.共检测到含WD40 repeat结构域(WD40 repeat)等20个蛋白结构域.rLV组和rLV-TUC338组中有显著差异的结构域包括Haem peroxidase,animal等.主要亚细胞成分及主要差异亚细胞成分均为核蛋白,分别占34.23%、24.22%.rLV组和rLV-TUC338组中下调的互作网主要包括:prot1(P37268)-prot2(095864)、prot1(Q6FGH9)-prot2(Q13363)等.上调的互作网主要包括:prot1(P60520)-prot2(A0A024RBQ5)、prot1(P60520)-prot2(Q06330)等.结论 Lnc RNA TUC338 影响了人类宫颈癌细胞的蛋白组学,是宫颈癌的抑癌基因,并通过糖代谢、磷酸化、细胞骨架这3个通路抑制肿瘤发展.
文献关键词:
宫颈癌;长链非编码RNATUC338;非标记定量法;蛋白组学
中图分类号:
作者姓名:
蒋漪桦;朱宇;杜洪灵;秦锦龙;刘晔;宋君雅;蔡骁垚;金姝
作者机构:
南华大学衡阳医学院,湖南衡阳 421001;上海市普陀区人民医院妇产科,上海200060;上海市普陀区人民医院检验科,上海200060;上海市普陀区人民医院中心实验室,上海200060
文献出处:
引用格式:
[1]蒋漪桦;朱宇;杜洪灵;秦锦龙;刘晔;宋君雅;蔡骁垚;金姝-.Lnc RNA TUC338影响人类宫颈癌细胞的蛋白组学分析)[J].医学信息,2022(13):18-27
A类:
TUC338,人类宫颈癌细胞,RNATUC338,hTUC338,LncRNATUC338,非标记定量法,HNRNPH3,EPPK1,AKR1C2,Haem,prot1,P37268,prot2,Q6FGH9,Q13363,P60520,A0A024RBQ5,Q06330
B类:
蛋白组学,组学分析,长链非编码,Hela,rLV,ZsGreen,Puro,慢病毒,质谱分析,白条,条带,LAMB1,COX2,ITPR1,磷酸化修饰,细胞骨架,半乳糖,糖代谢,代谢通路,肌动蛋白,调节通路,WD40,repeat,蛋白结构域,peroxidase,animal,亚细胞,细胞成分,主要差异,核蛋白,网主,抑癌基因,肿瘤发展
AB值:
0.165492
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