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典型文献
基于LINCS转录组数据以囊泡谷氨酸转运体1为靶点的抗阿尔茨海默病药物重定位
文献摘要:
目的 利用基于网络细胞反应印记整合文库(LINCS)提供的药物扰动基因表达谱数据和阿尔茨海默病(AD)谷氨酸毒性发病机制,以囊泡谷氨酸转运体1(VGLUT1)为靶点进行抗AD药物重定位预测.方法 利用MetaCore数据库构建VGLUT1调控基因集,基于LINCS提供的药物扰动基因表达谱数据,采用基因富集分析评估药物调控VGLUT1转录潜能,预测靶向调控VGLUT1转录的抗AD药物.以快速老化模型小鼠(SAMP8)为模型,用Morris水迷宫实验和新异物体识别实验评价小鼠学习记忆功能,对预测药物的抗AD作用进行验证.结果 获得了包括16个激活VGLUT1转录和11个抑制VGLUT1转录的基因集;富集分数排名前5具有促进VGLUT1转录作用的药物为氟尼缩松、谷氨酰胺、阿那曲唑、米非司酮和雷替曲塞.米非司酮可显著增加SAMP8在水迷宫目标象限的游泳时间(P<0.05),而对新异物体识别实验中的偏好指数无显著影响.结论 基于LINCS转录组数据和VGLUT1特征基因集的药物重定位为抗AD药物发现提供了一个新的易实现的参考方法.米非司酮具有成为抗AD药物的前景.
文献关键词:
阿尔茨海默病;药物重定位;基因表达谱;囊泡谷氨酸转运体;米非司酮
作者姓名:
谢宗杰;王静;韩露;王同兴;高圣乔;程肖蕊;周文霞;张永祥
作者机构:
南京中医药大学研究生学院,江苏 南京 210023;军事科学院军事医学研究院毒物药物研究所,抗毒药物与毒理学国家重点实验室,北京 100850
引用格式:
[1]谢宗杰;王静;韩露;王同兴;高圣乔;程肖蕊;周文霞;张永祥-.基于LINCS转录组数据以囊泡谷氨酸转运体1为靶点的抗阿尔茨海默病药物重定位)[J].中国药理学与毒理学杂志,2022(09):641-648
A类:
囊泡谷氨酸转运体,MetaCore,快速老化模型小鼠
B类:
LINCS,转录组数据,抗阿尔茨海默病,药物重定位,印记,文库,基因表达谱,谱数据,AD,VGLUT1,定位预测,数据库构建,调控基因,基因富集分析,分析评估,靶向调控,SAMP8,Morris,水迷宫实验,新异,异物,物体识别,实验评价,学习记忆功能,数排,缩松,谷氨酰胺,阿那,那曲,米非司酮,雷替曲塞,象限,游泳时间,特征基因,药物发现,参考方法
AB值:
0.246145
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