典型文献
基于单细胞转录组测序分析人肋来源软骨细胞的异质性
文献摘要：
背景:肋软骨是人体组织中一类重要的软骨来源,常作为软骨自体移植和组织工程构建的种子细胞来源.单细胞测序是分析细胞异质性的强大工具,可针对肋软骨细胞进行细胞异质性的深入研究.目的:通过单细胞转录组测序分析人肋软骨组织细胞分群情况,以及每个细胞亚群参与的生物学过程.方法:临床获取1例31岁小耳重建手术后废弃的肋软骨组织制成原代细胞悬液,经10X Genomics平台进行单细胞分离,使用Gel Bead Kit V3构建单细胞RNA-seq文库,Illumina Novaseq6000测序仪对文库进行测序,并利用主成分分析和T分布随机邻域嵌入进行降维,获得4个亚群细胞,进而获得不同亚群细胞的标记基因,再对每个细胞亚群的标记基因进行GO和KEGG分析,分析这些基因可能参与的生物学过程.结果 与结论:测序共获取6634个细胞,符合质控标准.将肋软骨细胞划分为4个细胞亚群,分别为以COL10A1、S100A2为标记基因的肥大软骨细胞群;以BMP2、COL2A1为标记基因的软骨细胞群;以FOS、JUN为标记基因的增殖性细胞群;以MYLK、CD146为标记基因的干细胞群.将肋软骨细胞进一步划分细胞亚群,有利于深入了解肋软骨细胞的异质性,对其作为种子细胞应用及疾病认识都有积极意义.
文献关键词：
单细胞转录组;测序;肋软骨;软骨细胞;标记基因;细胞分群
中图分类号：
作者姓名：
师航;李佳;刘霞;蒋海越
作者机构：
中国医学科学院北京协和医学院整形外科医院研究中心,北京市 100144
文献出处：
引用格式：
[1]师航;李佳;刘霞;蒋海越-.基于单细胞转录组测序分析人肋来源软骨细胞的异质性)[J].中国组织工程研究,2022(19):3011-3017
A类：
Novaseq6000
B类：
单细胞转录组测序,转录组测序分析,软骨细胞,肋软骨,自体移植,组织工程,种子细胞,单细胞测序,细胞异质性,软骨组织,组织细胞,细胞分群,群情,细胞亚群,生物学过程,手术后,织制,原代细胞,细胞悬液,10X,Genomics,单细胞分离,Gel,Bead,Kit,V3,文库,Illumina,分布随机邻域嵌入,标记基因,共获,质控标准,COL10A1,S100A2,肥大,BMP2,COL2A1,FOS,JUN,增殖性,MYLK,CD146,疾病认识
AB值：
0.310435
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