典型文献
应用单细胞测序转录组分析骨巨细胞瘤的免疫环境特征及免疫逃逸机制
文献摘要:
目的:通过单细胞转录组测序揭示骨巨细胞瘤特殊的免疫浸润环境以及可能存在的免疫逃逸机制。方法:收集2018年1月至2021年12月4例原发性骨巨细胞瘤患者手术获得的肿瘤新鲜标本,采用10X平台进行单细胞转录组测序,使用
t-分布领域嵌入算法(
t-distributed stochastic neighbor embedding,
t-SNE)降维分析将单细胞数据可视化及定量。对4例标本的35 643个单细胞数据进行细胞聚类、基本细胞类型的定义、免疫细胞的分类以及细胞类型之间的相互调控关系分析,探究骨巨细胞瘤免疫环境的特征。通过细胞通讯分析,观察骨巨细胞瘤中免疫细胞调节及作用的主要细胞类型及主要作用的信号通路。
结果:骨巨细胞瘤由9种基本细胞类型组成,其中免疫细胞以CD8
+ T细胞为主约占51%,非免疫细胞以成纤维细胞样梭形基质细胞为主,约占74%。在骨巨细胞瘤的免疫浸润中细胞毒性的CD8
+ T细胞占比最高(49%),而耗竭状态的CD8
+ T细胞占比最低(5%)。CD4
+ T细胞以高表达免疫检查点基因
CTLA4和
TIGIT为特征。骨巨细胞瘤中CD8
+ T细胞及NK细胞主要通过PARs和CCL两条信号通路的调控作用于多核破骨样巨细胞,而非基质细胞。
结论:通过单细胞测序数据定义了骨巨细胞瘤的主要组成细胞类型,并进一步揭示了其免疫浸润的组成特征,且发现其免疫细胞的作用对象主要为多核破骨样巨细胞,为更加深入了解骨巨细胞瘤发生、发展提供了有效信息。
文献关键词:
骨巨细胞瘤;单细胞分析;CD8阳性T淋巴细胞;肿瘤逃逸
中图分类号:
作者姓名:
任志午;张超;刘俊阳;谢越;廖智超;李婷;刘新月;邢汝维;宋建民;杨吉龙
作者机构:
天津医科大学肿瘤医院骨与软组织肿瘤科,国家恶性肿瘤临床医学研究中心,天津市恶性肿瘤临床医学研究中心,天津市肿瘤分子流行病重点实验室,天津 300060;天津市天津医院骨科,天津 300299;甘肃中医药大学临床学院,兰州 730099;甘肃省人民医院骨软科,兰州 730099
文献出处:
引用格式:
[1]任志午;张超;刘俊阳;谢越;廖智超;李婷;刘新月;邢汝维;宋建民;杨吉龙-.应用单细胞测序转录组分析骨巨细胞瘤的免疫环境特征及免疫逃逸机制)[J].中华骨科杂志,2022(21):1441-1449
A类:
PARs
B类:
单细胞测序,转录组分析,骨巨细胞瘤,免疫环境,环境特征,免疫逃逸,单细胞转录组测序,免疫浸润,10X,分布领域,领域嵌入,distributed,stochastic,neighbor,embedding,SNE,降维分析,数据可视化,细胞类型,免疫细胞,互调,关系分析,过细,细胞通讯,细胞调节,CD8
,成纤维细胞,基质细胞,细胞毒性,耗竭,CD4
,免疫检查点基因,CTLA4,TIGIT,NK,CCL,多核,破骨,骨样,序数,组成特征,有效信息,单细胞分析,肿瘤逃逸
AB值:
0.295281
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