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禽致病性大肠杆菌P型菌毛papA基因克隆与基因分型分析
文献摘要：
为克隆禽致病性大肠杆菌P型菌毛papA基因,确定其基因分型并分析其变异性,从GenBank数据库中查找大肠杆菌P型菌毛papA基因,并运用Snap Gene 3.2.1软件设计合成3对引物.其中,第1对引物为扩增不同基因分型通用引物,预计扩增片段大小为281 bp;第2对和第3对引物是为了扩增完整papA基因并分析有无变异而设计的,预计扩增片段大小分别为522 bp和943 bp.以禽大肠杆菌HJ2、TK3菌株的基因组为模板进行PCR扩增;将所有扩增片段回收、酶切,并分别与pTG19-T载体进行连接,转化进入DH5α受体菌,提取获得含扩增片段的重组质粒,测序并进行序列分析.结果表明,用引物1从HJ2、TK3菌株的基因组中均扩增获得接近281 bp大小的片段,用引物2则只从HJ2菌株基因组中扩增获得接近522 bp大小的片段,而未能从TK3菌株基因组中扩增出片段;用引物3从TK3菌株基因组中扩增出接近943 bp大小的片段,而未能从HJ2菌株基因组中扩增出产物.经过基因碱基序列分析比对,完整的papA基因则位于943 bp的片段之中,确定HJ2和TK3两个菌株P型菌毛papA基因均属基因11型,但发现二者papA基因存在一定的碱基差异.PapA蛋白氨基酸序列比对发现,同属于基因11型的papA基因编码的PapA蛋白氨基酸序列也存在位点差异.
文献关键词：
禽大肠杆菌;P型菌毛;papA基因
中图分类号：
作者姓名：
陈俊红;蔡煜;戴薇;雷卫强;戴鼎震
作者机构：
金陵科技学院动物科学与食品工程学院,江苏 南京 210046
文献出处：
引用格式：
[1]陈俊红;蔡煜;戴薇;雷卫强;戴鼎震-.禽致病性大肠杆菌P型菌毛papA基因克隆与基因分型分析)[J].江苏农业学报,2022(06):1594-1602
A类：
papA,HJ2,TK3,pTG19,PapA
B类：
禽致病性大肠杆菌,菌毛,基因克隆,基因分型,变异性,GenBank,Snap,Gene,软件设计,设计合成,通用引物,bp,禽大肠杆菌,DH5,重组质粒,序列分析,出产,碱基序列,基差,氨基酸序列比对,同属,基因编码,在位
AB值：
0.16214
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