典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨泽泻三萜抗肝纤维化的作用机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学和分子对接方法探究泽泻三萜成分抗肝纤维化的潜在作用机制.方法 根据数据库筛选及文献调研选取以泽泻三萜中8种活性成分为研究对象,利用Swiss Target Prediction网络平台预测其作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库获取与肝纤维化有关的靶点,借助Cytoscape 3.7.2软件构建"活性成分-抗肝纤维化靶点"网络图,并通过度值筛选核心成分;使用String平台进行蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,结合Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络图,通过度值、节点紧密度、节点介度筛选关键靶点;采用DAVID数据库对泽泻三萜抗肝纤维化的作用靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;使用AutoDock软件对核心成分与关键靶点进行分子对接;考察乙酰泽泻醇C对油酸和棕榈酸诱导的小鼠正常肝细胞(NCTC-1469)上清液一氧化氮(nitric oxide,NO)水平的影响.结果 筛选出泽泻三萜中8种活性成分包括24-乙酰泽泻醇A、泽泻醇B、乙酰泽泻醇B、16β-甲氧基乙酰泽泻醇B、泽泻醇C、乙酰泽泻醇C、泽泻内酯D、25-甲氧基泽泻醇F,预测得到35个抗肝纤维化靶点,4个核心成分包括乙酰泽泻醇B、16β-甲氧基乙酰泽泻醇B、泽泻醇C、乙酰泽泻醇C,4个关键靶点包括蛋白激酶 Cα(protein kinase Cα,PRKCA)、丝裂原活化蛋白激酶 1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、磷酯酰肌醇-3激酶催化亚基γ(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit γ,PIK3CG)、MAPK8;基因富集分析得到GO功能条目142个、通路69条(P<0.05);分子对接结果显示,核心成分与关键靶点均有较强的潜在结合能力;网络药理学分析显示,泽泻三萜成分主要通过作用于脂多糖反应、凋亡等生物过程及肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、磷脂酰肌醇-3激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶 B(protein kinase B,Akt)、MAPK 等信号通路发挥抗肝纤维化作用.体外细胞实验结果显示乙酰泽泻醇C显著降低肝损伤细胞模型NO水平(P<0.05).结论 泽泻三萜中的活性成分乙酰泽泻醇B、16β-甲氧基乙酰泽泻醇B、泽泻醇C、乙酰泽泻醇C可能通过调节MAPK、PI3K/Akt等信号通路,从而发挥抗肝纤维化作用.
文献关键词:
泽泻三萜;肝纤维化;网络药理学;乙酰泽泻醇B;16β-甲氧基乙酰泽泻醇B;泽泻醇C;乙酰泽泻醇C
中图分类号:
作者姓名:
江雯;叶晨;胡熳;刘钰偲;张艳;梁继超;陈勇
作者机构:
湖北大学药物高通量筛选技术国家地方联合工程研究中心中药生物技术湖北省重点实验室,省部共建生物催化与酶工程国家重点实验室,湖北武汉 430062
文献出处:
引用格式:
[1]江雯;叶晨;胡熳;刘钰偲;张艳;梁继超;陈勇-.基于网络药理学和分子对接探讨泽泻三萜抗肝纤维化的作用机制)[J].中草药,2022(04):1100-1111
A类:
泽泻三萜,节点紧密度,基泽
B类:
网络药理学,分子对接,抗肝纤维化,对接方法,方法探究,潜在作用,文献调研,活性成分,Swiss,Target,Prediction,作用靶点,GeneCards,OMIM,Cytoscape,软件构建,网络图,核心成分,String,蛋白相互作用,protein,interaction,PPI,选关,关键靶点,DAVID,基因本体,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,通路富集分析,AutoDock,油酸,棕榈酸诱导,肝细胞,NCTC,上清液,一氧化氮,nitric,oxide,分包,甲氧基,内酯,kinase,PRKCA,丝裂原活化蛋白激酶,mitogen,activated,MAPK1,酶催化,催化亚基,phosphatidylinositol,bisphosphate,catalytic,subunit,PIK3CG,MAPK8,基因富集分析,条目,结合能,药理学分析,脂多糖,生物过程,tumor,necrosis,磷脂酰肌醇,PI3K,Akt,体外细胞实验,肝损伤,细胞模型
AB值:
0.264564
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