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基于转录组测序分析骨髓间充质干细胞对子宫内膜癌细胞的影响
文献摘要：
目的 探索骨髓间充质干细胞(bone mesenchymal stem cells,BMSCs)对子宫内膜癌Ishikawa细胞转录水平的影响.方法 用Lenti-EGFP慢病毒感染Ishikawa细胞,分别将表达增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)的Ishikawa细胞单独培养、与BMSCs接触共培养;通过流式细胞术分离Ishikawa细胞,并进行转录组测序分析筛选差异表达的mRNA和miRNA,通过miRWalk预测差异miRNA靶基因,对两者的交集基因进行GO、KEGG、蛋白网络互作分析;采用qRT-PCR和Western blot验证测序结果的准确性.结果 标记EGFP的Ishikawa细胞与BMSCs共培养后,分离出的Ishikawa-EGFP阳性细胞占33.6％,阴性细胞占10.5％.测序后共筛选出5 928个差异表达mRNA和111个差异表达miRNA.蛋白网络互作分析显示交集基因表达的蛋白之间相互作用,核心节点包括CDKN1A、JAK1、COL1A1、VCAN等.miRNA-mRNA网络图显示CDKN1A与hsa-let-7e-5p存在潜在靶向关系.GO分析和KEGG分析结果显示,其交集基因参与细胞外基质结构、细胞黏附分子结合等,并主要富集在PI3K-Akt、黏着斑、MAPK、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药等信号通路.qRT-PCR和Western blot结果显示,共培养后Ishikawa-EGFP细胞中CDKN1A表达上调,hsa-let-7e-5p表达下调.结论 BMSCs可能通过细胞间的相互作用调节肿瘤局部微环境并促进子宫内膜癌的发生发展.
文献关键词：
子宫内膜癌;骨髓间充质干细胞;共培养;转录组测序
中图分类号：
作者姓名：
蒙妮;赵冰冰;隆曜先;何珊;张洁清;李力
作者机构：
530021南宁 广西医科大学附属肿瘤医院妇科;400038重庆 第三军医大学陆军特色医学中心妇产科;646000四川 西南医科大学附属医院妇科
文献出处：
引用格式：
[1]蒙妮;赵冰冰;隆曜先;何珊;张洁清;李力-.基于转录组测序分析骨髓间充质干细胞对子宫内膜癌细胞的影响)[J].中国癌症防治杂志,2022(03):281-287
A类：
B类：
转录组测序分析,骨髓间充质干细胞,对子,子宫内膜癌细胞,bone,mesenchymal,stem,cells,BMSCs,Ishikawa,转录水平,Lenti,EGFP,慢病毒感染,增强型绿色荧光蛋白,enhanced,green,fluorescent,protein,共培养,过流,流式细胞术,差异表达,miRNA,miRWalk,靶基因,交集,蛋白网络,互作分析,qRT,blot,阳性细胞,白之,核心节点,CDKN1A,JAK1,COL1A1,VCAN,网络图,hsa,let,7e,5p,细胞外基质,基质结构,细胞黏附分子,分子结,PI3K,Akt,黏着斑,MAPK,EGFR,酪氨酸激酶抑制剂,过细,局部微环境
AB值：
0.327121
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