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基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒全基因组多重PCR测序方法的建立与评价
文献摘要：
目的:基于二代测序(next generation sequencing，NGS)技术建立一种发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)基因组的测序方法。方法:提取SFTSV阳性血清样本病毒核酸，利用Primer5.0软件设计SFTSV特异性引物，构建多重PCR方法对病毒核苷酸序列进行特异性扩增，利用二代测序仪进行全基因组测序。结果:28份SFTSV阳性血清样本均能进行特异性扩增并获得全序，覆盖度均超过94%, A型病毒株最多(20株)、其次为B型(4株)、E型(3株)。结论:本研究基于多重PCR建立了针对SFTSV的特异性强、质量好的高通量测序方法，提高了测序效率。
文献关键词：
发热伴血小板减少综合征病毒;多重PCR;高通量测序;基因组
中图分类号：
作者姓名：
王笑阳;裴书君;陈泽倩;索文帅;易志杰;李懿;黄学勇;郭万申
作者机构：
郑州大学公共卫生学院流行病学教研室，郑州 450001;新乡医学院公共卫生学院流行病学教研室，新乡 453000;河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所，郑州 450016
文献出处：
引用格式：
[1]王笑阳;裴书君;陈泽倩;索文帅;易志杰;李懿;黄学勇;郭万申-.基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒全基因组多重PCR测序方法的建立与评价)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(12):931-939
A类：
B类：
高通量测序技术,发热伴血小板减少综合征病毒,建立与评价,二代测序,next,generation,sequencing,NGS,severe,fever,thrombocytopenia,syndrome,virus,SFTSV,阳性血清,血清样本,本病,病毒核酸,Primer5,软件设计,特异性引物,全基因组测序,全序,覆盖度,毒株
AB值：
0.273633
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