典型文献
基于生物信息学的糖尿病肾脏疾病基因诊断模型的建立
文献摘要：
目的:利用生物信息学技术探讨糖尿病肾脏疾病（DKD）的潜在生物标志物及发病机制。方法:通过基因表达数据库下载GSE30528、GSE96804和GSE104948 3个DKD肾小球组织数据集，应用生物信息学技术与机器学习相结合的方法筛选DKD生物标志物并建立DKD基因诊断模型，并应用CIBERSORT算法分析DKD肾小球组织中免疫细胞浸润情况，探讨生物标志物与免疫细胞及模型风险评分与患者肾小球滤过率（eGFR）间的相关性。结果:从26个差异表达基因中筛选并建立了由
G6PC、
CDH10和
TPPP3组成的三基因模型，该模型在训练集（AUC=0.984）和验证集（AUC=0.992）均显示出良好的诊断效能。对DKD肾小球组织中浸润免疫细胞的分析表明，γδ T细胞、活化的自然杀伤（NK）细胞、M2巨噬细胞、静止的树突状细胞、静止的肥大细胞、激活的肥大细胞和中性粒细胞可能参与DKD过程，且
G6PC、
CDH10和
TPPP3与多种免疫细胞浸润相关。使用模型计算DKD患者的危险评分，评分越高，eGFR水平越低，风险评分与eGFR水平呈显著负相关。
结论: G6PC、
CDH10和
TPPP3可作为DKD的良好诊断标志物，与DKD免疫细胞浸润相关，可作为DKD诊断和治疗的靶点。
文献关键词：
糖尿病肾脏疾病;生物标志物;生物信息学;基因诊断模型;肾小球滤过率
中图分类号：
作者姓名：
徐华;陈佳;宋玉印
作者机构：
盘锦辽油宝石花医院检验科，盘锦 124010;盘锦辽油宝石花医院全科医学科，盘锦 124010
文献出处：
引用格式：
[1]徐华;陈佳;宋玉印-.基于生物信息学的糖尿病肾脏疾病基因诊断模型的建立)[J].国际生物医学工程杂志,2022(05):395-402,423
A类：
基因诊断模型,GSE30528,GSE96804,GSE104948,CDH10,TPPP3
B类：
糖尿病肾脏疾病,疾病基因,利用生物,生物信息学技术,技术探讨,DKD,潜在生物标志物,基因表达数据库,下载,CIBERSORT,算法分析,免疫细胞浸润,讨生,模型风险,风险评分,肾小球滤过率,eGFR,差异表达基因,G6PC,三基,训练集,验证集,诊断效能,杀伤,NK,M2,巨噬细胞,静止,树突状细胞,肥大细胞,诊断标志物,诊断和治疗
AB值：
0.186899
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