典型文献
大白猪繁殖性状全基因组关联分析
文献摘要：
本研究利用全基因组关联分析(GWAS)挖掘与大白猪总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和健仔数(NHP)相关的候选基因.选择1100头大白猪为实验材料,通过提取耳尾组织样DNA并利用"中芯一号"芯片进行基因型分型,采用PLINK v1.9对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究.rMVP软件对每个SNP与性状做关联分析,确定出显著位点.结果表明:对于TNB性状共有3个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NBA性状共有4个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NHP分析得到18个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著.在上述显著SNPs附近共有23个候选基因,根据基因功能注释推测ESR1、ZP3、YWHAG、HSPB1、MDH2、PCCB是能够影响繁殖性状的重要候选基因.
文献关键词：
猪;总产仔数;产活仔数;健仔数;全基因组关联分析
中图分类号：
作者姓名：
张宇;周佳伟;吴俊静;乔木;徐忠;李梓芃;彭先文;梅书棋
作者机构：
动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,湖北武汉430064
文献出处：
引用格式：
[1]张宇;周佳伟;吴俊静;乔木;徐忠;李梓芃;彭先文;梅书棋-.大白猪繁殖性状全基因组关联分析)[J].中国畜牧杂志,2022(08):94-99
A类：
rMVP,MDH2
B类：
大白猪,猪繁殖,繁殖性状,全基因组关联分析,研究利用,GWAS,总产仔数,TNB,产活仔数,NBA,健仔数,NHP,实验材料,基因型,PLINK,v1,质控,SNPs,基因功能注释,ESR1,ZP3,YWHAG,HSPB1,PCCB,重要候选基因
AB值：
0.297283
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
