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2000-2021年江西省O1群和O139群霍乱弧菌非产毒株基因组学研究
文献摘要：
目的 分析2000-2021年江西省O1群和O139群霍乱弧菌非产毒株的基因组变异特征.方法 使用基因组重测序技术获得菌株的基因组精细图,使用IQ-tree构建基于核心基因组单核苷酸多态性(SNP)的遗传系统发生树,使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)研究密切相关菌株的差异,使用最小抑制浓度(MIC)测定菌株的抗生素敏感性.结果 江西省的O1群和O139群霍乱弧菌非产毒株基因组多态性较引起霍乱流行和大流行的产毒株高,其中部分O1群霍乱弧菌非产毒株携带耐药质粒,表现出对多种抗生素的敏感性降低.结论 O1群和O139群霍乱弧菌的基因组多态性高,应该密切关注携带多耐药质粒的霍乱弧菌非产毒株.
文献关键词：
基因组;抗生素敏感性;质粒
中图分类号：
作者姓名：
王鹏;赵文轩;徐晓倩;周海健;熊长辉;李小英;章承锋;袁辉;杨梦
作者机构：
江西省疾病预防控制中心,江西南昌330029;山西医科大学公共卫生学院,山西太原030001;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206
文献出处：
引用格式：
[1]王鹏;赵文轩;徐晓倩;周海健;熊长辉;李小英;章承锋;袁辉;杨梦-.2000-2021年江西省O1群和O139群霍乱弧菌非产毒株基因组学研究)[J].疾病监测,2022(11):1419-1422
A类：
B类：
O139,霍乱弧菌,毒株,基因组学,组学研究,基因组变异,变异特征,基因组重测序,技术获得,IQ,tree,核心基因,单核苷酸多态性,SNP,系统发生树,脉冲场凝胶电泳,PFGE,最小抑制浓度,MIC,抗生素敏感性,基因组多态性,乱流,大流行,株高,耐药质粒,多耐药
AB值：
0.283281
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