目的 采用MLST方法及基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术研究我国主要沿海地区192株O1群霍乱弧菌的种群结构、进化趋势及流行特性.方法 PCR扩增192株O1群霍乱弧菌的7个管家基因adk、gyrB、mdh、metE、pntA、purM和pyrC,根据核酸序列信息获得其等位基因型及序列型(Sequence Type,ST).利用DnaSP 5.0及eBURST Version 3.0分析序列多样性,Split-sTree 4.0、STRUCTURE 2.2等软件分析霍乱弧菌种群结构特征,同时数据库中非O1/O139群对应的STs也纳入分析,以比较其与O1/O139群对应STs在克隆群和种群结构方面的关系.此外还应用BioTyper软件,对霍乱弧菌蛋白指纹图谱数据进行聚类分析.结果 192株O1群霍乱弧菌共22个序列型,其中11个为本研究新发现的序列型;ST189、ST191和ST184存在2个不同组别间的重组现象.SplitsTree 4.0种群结构分析结果显示,22个序列型共分成2个分支,STRUCTURE种群结构分析将22个序列型分为3个亚群,不同的16S rDNA序列存在共有的ST,如ST69、ST75和ST173;非O1/O139群对应的STs大部分以单体形式存在,仅形成4个克隆群,在种群结构分析中大部分STs与O1/O139群对应的STs划分到同一个亚群中;MALDI-TOF MS聚类分析结果显示,当距离为200时,22个STs被分为两组,当距离为100时,被分成3组;霍乱弧菌整体的重组率(包括O1/O139群和非O1/O139群)要远远高于O1/O139群的重组率.结论 192株O1群霍乱弧菌MLST分析表明ST69和ST75是O1群霍乱弧菌最主要的2个序列型.7个管家基因重组/突变的比值差异较大,但整体而言,重组比突变更容易发生.O1/O139群和非O1/O139群霍乱弧菌间仍存在较大差异.霍乱弧菌MLST分型与基于蛋白指纹图谱的分型结果间尚未发现明显的联系.

霍乱弧菌;O1血清群;多位点序列分型;基质辅助激光解析电离飞行时间质谱

柳婷婷;李萍;杨文辉;金大智;高姗;王菁;王景林;康琳;辛文文

河北师范大学生命科学学院,河北省动物生理生化与分子生物学重点实验室,石家庄050024;军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京 100071;杭州医学院,杭州 310059;浙江省疾病预防控制中心,杭州 310057

中国人兽共患病学报

[1]柳婷婷;李萍;杨文辉;金大智;高姗;王菁;王景林;康琳;辛文文-.我国主要沿海地区O1群霍乱弧菌分子分型特征分析)[J].中国人兽共患病学报,2022(01):10-18

adk,metE,pntA,purM,pyrC,sTree,BioTyper,ST189,ST191,ST184,SplitsTree,ST75,ST173

沿海地区,霍乱弧菌,分子分型,MLST,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱,Matrix,assisted,laser,desorption,ionization,flight,mass,spectrometry,MALDI,TOF,进化趋势,管家基因,gyrB,mdh,序列信息,等位基因,基因型,Sequence,DnaSP,eBURST,Version,STRUCTURE,菌种,种群结构特征,O139,STs,蛋白指纹图谱,谱数据,新发现,组别,亚群,16S,rDNA,ST69,分到,同一个,基因重组,整体而言,血清群,多位点序列分型

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