[目的]探索水稻叶绿素含量及其对氮肥响应的遗传机理,为氮高效、高光效的水稻品种培育提供新的标记区段.[方法]以珍汕97×明恢63重组自交系RIL(F11)113个家系为QTL分析的试验材料,在大田栽培条件下,以施氮量为主区、家系为裂区,设计低氮处理(不施氮肥)和正常氮处理(纯氮130、135 kg/hm2),分别于水稻移栽后30 d测定1.5叶的SPAD值,于抽穗期测定剑叶的SPAD值.利用包含1619个Bin标记的高密度遗传图谱,使用IciMapping V3.4软件和完备区间作图法,定位控制水稻叶片叶绿素含量的QTL.[结果]在两年、两个氮处理和两个发育时期共检测到15个调控叶片叶绿素含量的QTL,分别分布在第1、2、3、6、7、10、11号染色体上.单一QTL贡献率为1.21％～40.74％.通过物理位置比较,发现其中6个QTL已经被克隆或与前人定位到的叶绿素含量相关位点在同一区间.其中,在第6染色体的8.45～9.12 Mb处定位到1个调控抽穗期剑叶叶绿素的位点,命名为qHDCHL6-1,该位点在两年和两个氮处理下均被检测到,贡献率为1.55％～28.01％.结合功能注释,共筛选到4个与叶绿素代谢密切相关的基因,分别为LOC_Os06g15370(OsNPF3.1)、LOC_Os06g15420(OsAS2)、LOC_Os06g15620(GAST)和LOC_Os06g15590,其中前3个基因已被鉴定克隆.[结论]共检测到15个控制水稻移栽后30 d和抽穗期叶片叶绿素含量的QTL,鉴定了1个稳定表达的QTL位点qHDCHL6-1,在该区间筛选到4个候选基因.

水稻;重组自交系;高密度Bin图谱;叶绿素含量;QTL

潘俊峰;崔克辉;刘彦卓;王昕钰;严博宇;梁开明

广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室/农业农村部华南优质稻遗传育种重点实验室,广东广州 510640;华中农业大学植物科技学院/作物遗传改良国家重点实验室/农业农村部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室,湖北武汉 430070

广东农业科学

[1]潘俊峰;崔克辉;刘彦卓;王昕钰;严博宇;梁开明-.利用高密度Bin图谱定位水稻叶绿素含量QTL)[J].广东农业科学,2022(09):132-140

qHDCHL6,Os06g15370,OsNPF3,Os06g15420,OsAS2,Os06g15620,Os06g15590

Bin,稻叶,QTL,遗传机理,氮高效,高光效,水稻品种,品种培育,区段,重组自交系,RIL,F11,家系,大田栽培,栽培条件,施氮量,裂区,低氮,氮处理,施氮肥,hm2,移栽,SPAD,抽穗期,剑叶,高密度遗传图谱,IciMapping,V3,作图法,定位控制,叶片叶绿素含量,发育时期,位置比,人定,Mb,该位,功能注释,叶绿素代谢,LOC,GAST,稳定表达,候选基因

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