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基于微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络的骨关节炎病变的相关分子机制研究
文献摘要:
目的:基于miRNA-mRNA调控网络进行生物信息学分析,探讨骨关节炎病变的相关分子机制。方法:从GEO数据库下载人血清样本miRNA表达数据集,通过R语言limma包获取差异表达miRNA,采用miRwalk 2.0版数据库预测其对应靶基因(mRNA),并构建miRNA-mRNA调控网络。对靶基因进行功能GO分析和KEGG信号通路分析,构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络(PPI),从中筛选出骨关节炎病变的核心基因。结果:共筛选出7个差异表达的miRNA(表达均为下调)和900个mRNA,这些基因主要涉及蛋白结合、DNA结合、转录等生理过程,参与Cell cycle、p53、Neurotrophin、PI3K-Akt等信号通路。蛋白相互作用分析表明MAPK1、TP53、MAPK14、CCND1、EP300、POLR2E、POLR2F、ABL1、RAC1、SKIV2L2为该调控网络的核心靶基因。结论:OA的发生和发展涉及多个的miRNA、靶基因和作用途径,而通过构建骨关节炎相关miRNA-mRNA调控网络,可为找出骨关节炎病的分子机制和今后临床上诊疗提供新的思路。
文献关键词:
骨关节炎;微小核糖核酸;信使核糖核酸;调控网络
作者姓名:
程晓平;郑文伟;倪国新
作者机构:
福建医科大学附属第一医院康复医学科,福州 350000;福建省微生物研究所,福州 350000;北京体育大学,北京 100084
引用格式:
[1]程晓平;郑文伟;倪国新-.基于微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络的骨关节炎病变的相关分子机制研究)[J].中华物理医学与康复杂志,2022(04):306-311
A类:
POLR2E,POLR2F,SKIV2L2
B类:
微小核糖核酸,信使核糖核酸,调控网络,骨关节炎,miRNA,生物信息学分析,GEO,下载,载人,人血清,血清样本,limma,差异表达,miRwalk,靶基因,对靶,通路分析,蛋白质相互作用网络,PPI,核心基因,蛋白结合,生理过程,Cell,cycle,p53,Neurotrophin,PI3K,Akt,蛋白相互作用,相互作用分析,TP53,MAPK14,CCND1,EP300,ABL1,RAC1,OA,作用途径
AB值:
0.318089
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