典型文献
灰葡萄孢鞘脂代谢通路基因Bcsphl1克隆及功能分析
文献摘要：
为明确灰葡萄孢Botrytis cinerea鞘脂代谢通路基因Bcsphl1的生物信息学特征及其在菌核发育中的潜在功能,采用CTAB法和Trizol法提取灰葡萄孢菌丝、菌核的gDNA和总RNA,利用PCR技术克隆其BcSphl1基因,运用生物信息学软件对其进行鉴定和分析,并利用半定量反转录-聚合酶链反应(semi-quantitative reverse transcription and polymerase chain reaction,SqRT-PCR)技术测定其在灰葡萄孢菌核不同形成阶段的表达情况.结果表明:Bcsphl1基因序列全长1 833 bp,编码360个氨基酸;Bcsphl1基因编码蛋白的分子质量为40.94 kD,理论等电点为7.73,分子式为C1889H2868N4920507S11,不稳定系数为31.19,脂肪指数为100.47,亲水性平均指数为0.160,属于结构稳定的疏水性蛋白.该基因编码的蛋白质无信号肽,定位于细胞质膜,含有3个跨膜结构域和1个脂肪酸羟化酶保守结构域.氨基酸序列同源性比对发现Bcsphl1氨基酸序列与灰葡萄孢T4菌株鞘氨醇羟化酶类蛋白的一致性达98.23％.Bcsphl1基因在灰葡萄孢菌核形成初期(6 d)、中期(9 d)和后期(12 d)均有较高水平表达,其中在中期表达水平最高,表明其可能参与灰葡萄孢菌核形成的调控.
文献关键词：
灰葡萄孢;鞘氨醇羟化酶;基因克隆;基因表达;菌核形成;功能
中图分类号：
作者姓名：
李俊;宋娟娟;周映君;李国庆;张静
作者机构：
华中农业大学植物科学技术学院,湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室,武汉430070;中国农业科学院麻类研究所,长沙410205
文献出处：
引用格式：
[1]李俊;宋娟娟;周映君;李国庆;张静-.灰葡萄孢鞘脂代谢通路基因Bcsphl1克隆及功能分析)[J].植物保护学报,2022(04):1046-1052
A类：
Bcsphl1,BcSphl1,C1889H2868N4920507S11,鞘氨醇羟化酶
B类：
鞘脂代谢通路,代谢通路基因,功能分析,Botrytis,cinerea,核发,CTAB,Trizol,灰葡萄孢菌,菌丝,gDNA,生物信息学软件,半定量,聚合酶链反应,semi,quantitative,reverse,transcription,polymerase,chain,reaction,SqRT,形成阶段,基因序列,全长,bp,基因编码,编码蛋白,分子质量,kD,等电点,分子式,不稳定系数,脂肪指数,亲水性,结构稳定,疏水性,信号肽,细胞质,质膜,跨膜结构域,保守结构域,氨基酸序列,序列同源性,T4,酶类,菌核形成,基因克隆
AB值：
0.312205
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