目的 建立一种新型肾透明细胞癌焦亡相关基因风险模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因型组织表达(GTEx)数据库分别下载了522例肾透明细胞癌(KIRC)患者和72例正常组织样本.对TCGA和GTEx的数据进行差异分析,采用单因素和多因素COX回归分析以及LASSO Cox回归分析构建基因风险模型.使用国际癌症基因组联盟(ICGC)数据作为外部验证数据集.对TCGA_KIRC队列的高、低风险组进行基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,探讨高、低风险组之间基因功能和通路的差异.利用CIBERSORT数据库探讨高、低风险组的免疫浸润情况.结果 通过差异分析,得到13个差异表达的焦亡相关基因.采用单因素、多因素和LASSO Cox回归分析构建1个6基因风险模型.Kaplan-Meier分析结果显示,两个队列中高风险组生存时间均短于低风险组.在TCGA_KIRC队列中,1、2、3年曲线下面积(AUC)分别为0.710、0.683和0.727.在ICGC_RECA队列中,1、2、3年曲线下面积为0.592、0.531和0.545.独立预后分析显示,风险分数是1个独立预后因素.GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果表明,其主要与免疫和炎症反应相关.肿瘤的免疫浸润结果表明,高风险组中CD4+T细胞调节性T细胞、自然杀伤细胞、单核细胞、M2巨噬细胞和嗜酸性粒细胞浸润水平低,B细胞、CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞浸润水平高.结论 细胞焦亡相关基因可能在KIRC肿瘤免疫中发挥重要作用,联合与细胞焦亡相关的6基因风险模型可以为KIRC患者的个性化治疗方案提供预测依据.

肾透明细胞癌;免疫浸润;预后;LASSO Cox回归分析;人

王万里;任伟南;赵千;石贞玉;厉永强

河南大学口腔医学院,河南开封 475004;河南大学基础医学院医学生物信息学研究所,河南开封 475004

解剖学报

[1]王万里;任伟南;赵千;石贞玉;厉永强-.一种新型肾透明细胞癌焦亡相关基因预后风险模型的建立和验证)[J].解剖学报,2022(05):620-627

RECA

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