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草菇不同菌株RT-qPCR参考基因筛选
文献摘要：
适合的参考基因是应用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术进行基因表达分析的前提.本研究以7个食用菌常用参考基因(β-TUB 1、GPD、ACTB、Ras、α-TUB、β-TUB 2和SPRYp)为候选基因,利用RT-qPCR检测其在草菇常用生产菌株(CPS)V844、V5、V971和V844继代退化菌株(SDS)T8、T12、T16、T20中的表达;用Genorm、NormFinder和BestKeeper 3种软件分析候选基因的表达稳定性,并结合几何平均数法筛选出最佳参考基因.结果表明,SPRYp、α-TUB和β-TUB 2基因适用于草菇常用生产菌株检测,SPRYp、GPD和α-TUB基因适用于草菇继代退化检测,SPRYp 基因适用于两种条件的检测.两两差异分析表明,草菇常用生产菌株的最佳参考基因组合为SPRYp、α-TUB和β-TUB 2,继代退化菌株的最佳参考基因组合为SPRYp和GPD,两种条件混合菌株的最佳参考基因组合为SPRYp 和α-TUB.
文献关键词：
草菇;参考基因;RT-qPCR分析;常用生产菌株;继代退化菌株
中图分类号：
作者姓名：
王文沛;谭强飞;程志虹;孙万合;贠建民;赵风云
作者机构：
甘肃农业大学食品科学与工程学院,甘肃兰州730070
文献出处：
引用格式：
[1]王文沛;谭强飞;程志虹;孙万合;贠建民;赵风云-.草菇不同菌株RT-qPCR参考基因筛选)[J].菌物学报,2022(05):749-758
A类：
SPRYp,常用生产菌株,V844,V971,继代退化菌株,Genorm
B类：
草菇,qPCR,参考基因,基因筛选,基因表达分析,食用菌,TUB,GPD,ACTB,Ras,候选基因,CPS,V5,SDS,T8,T12,T16,T20,NormFinder,BestKeeper,表达稳定性,几何平均,平均数,基因组合,混合菌株
AB值：
0.210206
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