典型文献
紫玉兰'红元宝'花芽分化阶段基因定量分析的内参基因筛选
文献摘要:
为筛选紫玉兰'红元宝'(Magnolia liliflora'Hongyuanbao')二次花芽分化阶段稳定表达的内参基因,该研究以'红元宝'不同花芽分化时期的花芽和叶为材料,基于转录组数据,筛选出8个候选内参基因,即泛素酶基因(UBC)、肌动蛋白(ACT)、微管蛋白 β 链(β-TUB)、微管蛋白 β-5链(β-TUB5)、微管蛋白 α-3链(α-TUB3)、磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPC)、酰基载体蛋白2(ACP2)、酰基载体蛋白3(ACP3).运用Primer Premier 5设计引物,简单克隆和熔解曲线验证引物特异性;利用qRT-PCR技术检测各个候选内参基因的表达情况,结合GeNorm、NormFinder、BestKeeper软件和RefFinder在线工具综合评估其表达稳定性,并通过目的基因TFL1的表达分析验证其可靠性.结果表明:(1)8个候选内参基因条带位置正确,熔解曲线呈单一峰,说明引物特异性良好.(2)β-TUB、β-TUB5和α-TUB3是'红元宝'不同花芽分化时期较为稳定的内参基因,而UBC和ACT为稳定性最低的内参基因.(3)β-TUB5、α-TUB3、β-TUB及其组合的相对表达量趋于一致,而ACT和UBC并未对目的基因的表达量进行有效的标准化.因此,β-TUB、β-TUB5和α-TUB3可作为'红元宝'二次花芽分化研究中稳定表达的内参基因.该研究结果将为木兰属植物二次成花分子调控机制研究提供依据.
文献关键词:
紫玉兰;内参基因;两次成花;qRT-PCR;微管蛋白基因
中图分类号:
作者姓名:
章颖佳;程少禹;王卓为;戴梦怡;董彬;张超;张寿洲;王亚玲;申亚梅
作者机构:
浙江农林大学 风景园林与建筑学院,杭州311300;浙江农林大学 浙江省园林植物种质资源创新与利用重点实验室,杭州311300;仙湖植物园,广东 深圳518004;西安植物园,西安710061
文献出处:
引用格式:
[1]章颖佳;程少禹;王卓为;戴梦怡;董彬;张超;张寿洲;王亚玲;申亚梅-.紫玉兰'红元宝'花芽分化阶段基因定量分析的内参基因筛选)[J].广西植物,2022(01):113-121
A类:
liliflora,Hongyuanbao,TUB5,TUB3,ACP2,ACP3,两次成花
B类:
紫玉兰,元宝,花芽分化,基因定量,内参基因,基因筛选,Magnolia,稳定表达,同花,分化时,转录组数据,泛素,酶基因,UBC,肌动蛋白,ACT,烯醇,丙酮酸羧化酶,PEPC,酰基,载体蛋白,Primer,Premier,引物,单克隆,熔解曲线,qRT,GeNorm,NormFinder,BestKeeper,RefFinder,表达稳定性,过目,目的基因,TFL1,表达分析,分析验证,条带,一峰,相对表达量,木兰属,分子调控机制,微管蛋白基因
AB值:
0.271177
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