典型文献
基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析
文献摘要：
为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对168份种质材料进行RAD-seq测序,构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析.结果表明,比对参考基因组平均比对率为81.02％,平均测序深度23.18×,最终获得45552个高质量的SNPs.群体遗传结构分析表明,供试蓝花楹可划分为2个大的类群,来自川、渝地区的种质材料基本归为一类;其余地区归为另一类.19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高,云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)和期望杂合度(He)最大,表现出最高的遗传多样性.因此,来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系,推断来自同一祖先,而其余地区的种质可能是随机引种栽培.
文献关键词：
蓝花楹;RAD-seq;遗传多样性;群体遗传
中图分类号：
作者姓名：
刘学锋;李小梅;张国武;张沛健;刘果;黄敏;陈银霞
作者机构：
中国林业科学研究院速生树木研究所,广东 湛江 524022;湛江科技学院,广东 湛江 524000;江西省林业科技推广和宣传教育中心,南昌 330033
文献出处：
引用格式：
[1]刘学锋;李小梅;张国武;张沛健;刘果;黄敏;陈银霞-.基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析)[J].热带亚热带植物学报,2022(05):613-622
A类：
Jacaranda,mimosifolia,YNKM
B类：
RAD,蓝花楹,遗传分析,种质资源,群体遗传结构,种质材料,seq,系统进化树,群体结构,遗传多样性分析,参考基因,SNPs,遗传结构分析,类群,余地,另一类,云南昆明,居群,核苷酸多样性,杂合度,He,亲缘关系,祖先,引种栽培
AB值：
0.2696
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