典型文献
加权基因共表达网络分析在畜禽研究中的应用
文献摘要:
为了解加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法在畜禽中的应用研究,本文对近年来国内外通过WGCNA方法对牛、羊、猪、禽等畜禽进行研究的相关文献进行了整理与分析,总结了 WGCNA方法应用的一般分析流程、策略及畜禽WGCNA的研究现状.结果表明:WGCNA是一种系统生物学的方法,可分析转录组、蛋白组、代谢组、DNA甲基化和单细胞转录组等高通量数据,解析分子间调控的表达模式,确定关键调控因子;在畜禽的研究中,WGCNA方法已经广泛应用在生长性状、繁殖性状、抗病性状和品质性状等复杂性状的优势功能因子的挖掘.综上,WGCNA方法对分析组学数据具有较强的优势,可为畜禽重要经济性状的挖掘,阐明性状生物学机制提供助力.
文献关键词:
WGCNA;网络分析;高通量测序;畜禽
中图分类号:
作者姓名:
龚高;严晓春;王凤红;张磊;李文泽;闫晓敏;刘虹夫;吕琦;李金泉;苏蕊
作者机构:
内蒙古农业大学动物科学学院/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室/内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心,呼和浩特010018;内蒙古金莱牧业科技有限责任公司,呼和浩特010018
文献出处:
引用格式:
[1]龚高;严晓春;王凤红;张磊;李文泽;闫晓敏;刘虹夫;吕琦;李金泉;苏蕊-.加权基因共表达网络分析在畜禽研究中的应用)[J].中国农业大学学报,2022(07):159-171
A类:
畜禽研究
B类:
加权基因共表达网络分析,Weighted,gene,co,expression,network,analysis,WGCNA,种系,系统生物学,蛋白组,代谢组,甲基化,单细胞转录组,高通量数据,表达模式,调控因子,生长性状,繁殖性状,抗病性状,品质性状,复杂性状,功能因子,组学数据,重要经济性状,明性,生物学机制
AB值:
0.328681
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