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水稻响应盐胁迫关键转录因子的鉴定
文献摘要：
盐胁迫是影响水稻生产的重要非生物胁迫之一.本研究以盐胁迫条件下的水稻转录组数据为材料,通过HTSeq和DESeq软件分析转录因子在转录组水平上的表达变化.主要结果如下:水稻在盐胁迫1、3和6h三个时间点共有26个相同的差异表达转录因子,通过蛋白互作筛选出14个基因组成的重要模块;重要模块基因GO分析主要富集在ATP结合功能、对胁迫反应的过程以及细胞质膜囊泡组分上,KEGG分析主要富集在内质网蛋白质加工和内吞作用的通路上;同时鉴定出受盐胁迫诱导表达的关键热激转录因子基因0s03g0745000和Os06g0553100.推测这两个基因可能通过调控HSP70基因的转录表达,影响蛋白质折叠和组装,从而在水稻响应盐胁迫的过程中发挥作用.该研究为后续进行水稻遗传改良提供了候选基因,对进一步认识耐盐机制提供科学启示.
文献关键词：
水稻;关键转录因子;盐胁迫;蛋白互作;转录组
中图分类号：
作者姓名：
张斌;杨昕霞
作者机构：
湖南科技学院湖南省银杏工程技术研究中心,永州425199
文献出处：
引用格式：
[1]张斌;杨昕霞-.水稻响应盐胁迫关键转录因子的鉴定)[J].生物技术通报,2022(03):9-15
A类：
HTSeq,0s03g0745000,Os06g0553100
B类：
盐胁迫,关键转录因子,响水,水稻生产,非生物胁迫,胁迫条件,转录组数据,DESeq,表达变化,6h,差异表达,蛋白互作,ATP,胁迫反应,细胞质,质膜,膜囊泡,内质网,蛋白质加工,内吞,诱导表达,热激转录因子,HSP70,转录表达,蛋白质折叠,遗传改良,候选基因,耐盐机制
AB值：
0.345869
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