典型文献
洛阳市人群芽囊原虫感染现状及基因亚型分析
文献摘要:
目的 了解洛阳市人群芽囊原虫感染情况及基因亚型分布.方法 2020年9月13—20日,采取整群随机抽样的方法选择洛阳市土源性线虫病流动监测点中的洛宁县作为调查点,分别在程家庄、西街村、中高村、南坡村、磨沟村等5个行政村抽取3周岁以上常住居民不少于200人.采集调查对象基本信息,包括姓名、性别、年龄、民族、职业、文化程度、村庄和调查前3个月内是否服用驱虫药.调查芽囊原虫感染者的生活卫生条件及临床体征等信息.提取感染者粪样DNA,PCR扩增芽囊原虫小亚基RNA(SSU rRNA)基因,测序后在GenBank数据库中进行BLAST比对,鉴定扩增序列所属基因亚型.采用Mega 7.0最大似然法构建基于SSU rRNA基因的系统发育树.采用SPSS 25.0统计学软件进行统计分析.结果 共调查890人,检出芽囊原虫阳性20例,总感染率为2.2%(20/890).其中男性感染率为2.0%(8/399),女性感染率为2.4%(12/491),二者差异无统计学意义(χ2=0.193,P>0.05).11~20岁年龄组感染率最高,为5.1%(3/59),不同年龄组间感染率差异有统计学意义(Fisher=11.895,P<0.05).农民感染率最高,为2.6%(17/653),不同职业感染率差异无统计学意义(Fisher=1.535,P>0.05).初中文化程度感染率最高,为2.7%(12/452),不同文化程度感染率差异无统计学意义(Fisher=1.283,P>0.05).中高村居民芽囊原虫感染率最高,为4.3%(7/164),5个行政村居民芽囊原虫感染率差异有统计学意义(Fisher=10.929,P<0.05).PCR扩增结果显示,20份样品扩增出芽囊原虫SSU rRNA基因片段,大小约1100 bp.测序结果以ST3基因亚型为主,占90.0%(18/20),ST1基因型占10.0%(2/20).磨沟村和中高村的感染者包括ST3和ST1基因亚型,南坡村和西街村的感染者均为ST3基因亚型.系统进化树结果显示,20份阳性粪样中,有18份与奥地利分离株(GenBank登录号MN914073.1)、德国分离株(GenBank登录号MK801403.1)和新加坡分离株(GenBank登录号KX618192.1)处于同一个进化分支,均为ST3基因亚型;2份分别与德国分离株(GenBank登录号MK801408.1)和奥地利分离株(GenBank登录号MN914072.1)处于同一个分支,为ST1基因亚型,测序结果一致.对20例感染者进行卫生条件及临床体征调查结果显示,使用旱厕或粪池者占65.0%(13/20),使用水冲厕所者占35.0%(7/20);家中饲养宠物或家畜者占45.0%(9/20);3例有腹痛、腹泻、腹胀等症状,分别为1例ST1亚型、2例ST3亚型;4例有大便干结等症状,分别为1例ST1基因亚型,3例ST3基因亚型.结论 洛阳市人群芽囊原虫总感染率较低,主要为ST3基因亚型.
文献关键词:
芽囊原虫;基因亚型;流行病学调查;洛阳市
中图分类号:
作者姓名:
陈慧慧;李云霞;宁超群;邓艳;张红卫;韦雪芳;锁慧芳;张颋;刘琴;陈军虎;田利光
作者机构:
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心),国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室,世界卫生组织热带病合作中心,国家级热带病国际联合研究中心,上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院,上海 200025;洛阳市疾病预防控制中心,洛阳 471000;西安医学院第三附属医院,西安710068;河南省疾病预防控制中心,郑州 450016;洛宁县疾病预防控制中心,洛宁 471799
文献出处:
引用格式:
[1]陈慧慧;李云霞;宁超群;邓艳;张红卫;韦雪芳;锁慧芳;张颋;刘琴;陈军虎;田利光-.洛阳市人群芽囊原虫感染现状及基因亚型分析)[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2022(02):216-222
A类:
MN914073,MK801403,KX618192,MK801408,MN914072
B类:
洛阳市,芽囊原虫,感染现状,基因亚型,亚型分析,感染情况,亚型分布,取整,整群,随机抽样,方法选择,土源性线虫病,流动监测,监测点,点中,洛宁县,查点,程家,家庄,西街,高村,南坡,磨沟,行政村,周岁,常住居民,姓名,文化程度,服用,驱虫药,感染者,卫生条件,临床体征,粪样,亚基,SSU,rRNA,GenBank,BLAST,Mega,最大似然法,系统发育树,出芽,感染率,中男,男性感染,不同年龄组,Fisher,职业感染,初中文化,不同文化,扩增结果,bp,ST3,ST1,基因型,系统进化树,奥地利,分离株,登录号,国分,新加坡,同一个,进化分支,征调,粪池,水冲,冲厕,厕所,饲养,养宠,宠物,家畜,腹痛,腹胀,大便,干结,流行病学调查
AB值:
0.287863
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